More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5517 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5517  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  100 
 
 
284 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5750  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  95.07 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.436516  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.19 
 
 
288 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  35.19 
 
 
288 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.33 
 
 
276 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.03 
 
 
305 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.72 
 
 
284 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  36.64 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  33.33 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.51 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.39 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.6 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4736  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.79 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  36.03 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  31.86 
 
 
289 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.67 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  28.87 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.73 
 
 
492 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.88 
 
 
289 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.89 
 
 
507 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.09 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.97 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.69 
 
 
275 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  31.23 
 
 
496 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.92 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.73 
 
 
501 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  32.14 
 
 
499 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.07 
 
 
507 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.7 
 
 
507 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  31.23 
 
 
490 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  35.94 
 
 
467 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.94 
 
 
292 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  30.94 
 
 
292 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.94 
 
 
292 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.94 
 
 
292 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.7 
 
 
461 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.94 
 
 
292 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.94 
 
 
292 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  30.94 
 
 
292 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.58 
 
 
488 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.75 
 
 
514 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.33 
 
 
512 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.88 
 
 
294 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.52 
 
 
488 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.58 
 
 
292 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.45 
 
 
515 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.35 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.86 
 
 
492 aa  99  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  31.7 
 
 
543 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  30.86 
 
 
492 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.21 
 
 
512 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.77 
 
 
450 aa  96.3  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  28.67 
 
 
494 aa  95.9  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0552  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.33 
 
 
288 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.46 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.76 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  30.22 
 
 
493 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  35.61 
 
 
845 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  32.96 
 
 
500 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.09 
 
 
493 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.63 
 
 
292 aa  92  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.87 
 
 
468 aa  92  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.73 
 
 
467 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.09 
 
 
530 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  29.1 
 
 
484 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.57 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.61 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.22 
 
 
506 aa  89  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0609  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.34 
 
 
278 aa  89  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.94537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.35 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  31.64 
 
 
485 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.42 
 
 
481 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  28.78 
 
 
484 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.1 
 
 
487 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.33 
 
 
537 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.05 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.47 
 
 
498 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.87 
 
 
467 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.64 
 
 
484 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1525  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.82 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  27.05 
 
 
504 aa  86.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.1 
 
 
484 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1571  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  33.2 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118942  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.98 
 
 
542 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  27.68 
 
 
484 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3208  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  45.45 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.426898  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.45 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  28.57 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2002  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.8 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.24 
 
 
484 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0849  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.58 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.09 
 
 
505 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5185  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  34.18 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  30.64 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  30.68 
 
 
516 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.22 
 
 
486 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.81 
 
 
518 aa  82.8  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4923  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  36.86 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.31 
 
 
479 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.29 
 
 
490 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>