More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5466 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  98.8 
 
 		 167 aa  331  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  93.41 
 
 		 167 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  91.02 
 
 		 167 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  90.42 
 
 		 167 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  96.55 
 
 		 147 aa  283  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  76.05 
 
 		 174 aa  246  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  72.05 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 160 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  66.19 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  45.81 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  44.81 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  46.23 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  41.88 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  31.86 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  34.42 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  34.94 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  27.44 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 219 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  35.64 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  30.4 
 
 		 213 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  28.91 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.95 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>