110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5451 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 206 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  97.09 
 
 		 204 aa  360  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  83.8 
 
 		 215 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  83.8 
 
 		 215 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  83.41 
 
 		 216 aa  307  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  83.87 
 
 		 216 aa  307  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  77.93 
 
 		 272 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  66.19 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  66.19 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  66.19 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  66.19 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  66.19 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  66.19 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  65.24 
 
 		 218 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  63.24 
 
 		 208 aa  201  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  55.91 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  42.18 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  44.74 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  44.74 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  52.59 
 
 		 173 aa  88.6  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  34.95 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  39.02 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  36.62 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  41.96 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  40.18 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  34.5 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2480  17 kDa surface antigen-like protein  32.82 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  43.64 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  45.61 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  38 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  38 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  38 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  38 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  47.89 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  39 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  43.75 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  46.48 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  46.48 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  46.48 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  46.48 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  46.48 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  64.29 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  46.48 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  46.48 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  33.65 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  33.65 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  46.48 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  51.72 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  42.67 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5575  surface antigen protein  37.61 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  41.33 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  38.96 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  44.64 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  44.64 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  44.64 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  44.64 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  44.64 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  44.64 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  44.64 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  41.33 
 
 		 274 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  58.14 
 
 		 177 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  54.76 
 
 		 146 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 		 155 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3644  surface antigen precursor  39.71 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  42.06 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  35.29 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  42.31 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  46.88 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  43.24 
 
 		 160 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  62.16 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  40.48 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  35.71 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  27.67 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  44 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  45.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  44 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  51.61 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  42.67 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  45.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  40.48 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  31.9 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  31.58 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  33.77 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0944  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  32.94 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  44 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  31.9 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  41.46 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  62.16 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  41.46 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  30.1 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  40.35 
 
 		 155 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  40.35 
 
 		 155 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  40.35 
 
 		 155 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  40.35 
 
 		 155 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  40.35 
 
 		 155 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  40.35 
 
 		 155 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>