More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5322 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 714 aa  1431    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  77.1 
 
 		 713 aa  1056    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  77.1 
 
 		 713 aa  1056    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  77.1 
 
 		 713 aa  1044    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  77.1 
 
 		 713 aa  1044    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  85.76 
 
 		 714 aa  1114    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  90.06 
 
 		 707 aa  1261    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  92.19 
 
 		 709 aa  1230    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  77.1 
 
 		 713 aa  1056    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  75.38 
 
 		 710 aa  1040    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  92.04 
 
 		 709 aa  1247    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  77.1 
 
 		 713 aa  1044    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  92.19 
 
 		 709 aa  1230    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  96.22 
 
 		 705 aa  1313    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  48.91 
 
 		 679 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  49.42 
 
 		 687 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  50.27 
 
 		 773 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.21 
 
 		 646 aa  382  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  36.68 
 
 		 662 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 		 667 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.79 
 
 		 751 aa  363  4e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  37.54 
 
 		 656 aa  363  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.62 
 
 		 645 aa  362  2e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.48 
 
 		 727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  36.72 
 
 		 704 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  36.33 
 
 		 641 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  38.01 
 
 		 693 aa  356  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  36.44 
 
 		 701 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  35.09 
 
 		 642 aa  353  8e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.58 
 
 		 720 aa  352  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  37.09 
 
 		 744 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  37.01 
 
 		 712 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  35.26 
 
 		 642 aa  349  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  39.01 
 
 		 727 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.14 
 
 		 806 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  39.07 
 
 		 776 aa  347  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  35.91 
 
 		 655 aa  345  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  38.84 
 
 		 727 aa  344  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 760 aa  343  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  38.35 
 
 		 728 aa  342  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.95 
 
 		 654 aa  340  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  38.03 
 
 		 728 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  35.52 
 
 		 730 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  33.7 
 
 		 750 aa  338  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  39.12 
 
 		 770 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  32.08 
 
 		 774 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.79 
 
 		 648 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  35.53 
 
 		 755 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  35.44 
 
 		 640 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.59 
 
 		 643 aa  333  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.59 
 
 		 643 aa  333  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  38.09 
 
 		 714 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.24 
 
 		 640 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  34.6 
 
 		 752 aa  332  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  37.74 
 
 		 714 aa  332  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.46 
 
 		 762 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.39 
 
 		 643 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  36.93 
 
 		 739 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.45 
 
 		 727 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 		 661 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.32 
 
 		 618 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.73 
 
 		 648 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  36.24 
 
 		 625 aa  323  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  36.7 
 
 		 720 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.46 
 
 		 761 aa  323  8e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  36.16 
 
 		 730 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  33 
 
 		 644 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.7 
 
 		 811 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  32.11 
 
 		 638 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  37 
 
 		 651 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.11 
 
 		 755 aa  320  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  36.01 
 
 		 763 aa  320  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.17 
 
 		 833 aa  320  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  33.27 
 
 		 643 aa  320  7e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  37.36 
 
 		 775 aa  320  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  33.45 
 
 		 643 aa  320  9e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  33.45 
 
 		 643 aa  320  9e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  43.91 
 
 		 766 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  33.83 
 
 		 668 aa  318  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  33.17 
 
 		 683 aa  317  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.77 
 
 		 712 aa  317  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.5 
 
 		 734 aa  317  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.46 
 
 		 824 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  33.17 
 
 		 683 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  33 
 
 		 683 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  37.61 
 
 		 827 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  37.99 
 
 		 723 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  37.43 
 
 		 827 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  31.22 
 
 		 665 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  43.5 
 
 		 797 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  36.71 
 
 		 732 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.53 
 
 		 676 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  43.58 
 
 		 777 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.29 
 
 		 824 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  43.58 
 
 		 777 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  33 
 
 		 683 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  33 
 
 		 683 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  42.59 
 
 		 804 aa  314  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  32.57 
 
 		 683 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  35.84 
 
 		 735 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>