More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5291 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
293 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.95 
 
 
293 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.71 
 
 
291 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.28 
 
 
291 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.28 
 
 
291 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.28 
 
 
291 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.64 
 
 
291 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.73 
 
 
282 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
282 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.68 
 
 
289 aa  255  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
292 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
279 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 
276 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
282 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 
293 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 
278 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 
295 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 
280 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 
280 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  44.91 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  44.91 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  44.91 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  41.45 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  44.19 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 
284 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
279 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
286 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 
280 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
282 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
280 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
276 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
290 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
284 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 
276 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
285 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  43.23 
 
 
285 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 
276 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.61 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
280 aa  195  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
284 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
277 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
275 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  41.49 
 
 
280 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
272 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
276 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
290 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
290 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  40.15 
 
 
278 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
285 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  40.31 
 
 
283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
294 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 
276 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
284 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
272 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
273 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 
274 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 
283 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
281 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
279 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
283 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
279 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
281 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 
279 aa  185  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
274 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
276 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
279 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 
275 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
282 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
273 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
275 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  34.6 
 
 
278 aa  179  4e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.45 
 
 
284 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 
279 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
280 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
276 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
299 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
281 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
281 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
275 aa  175  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>