More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5108 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  98.21 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  83.93 
 
 		 220 aa  318  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  82.06 
 
 		 221 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  82.06 
 
 		 221 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  82.06 
 
 		 221 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  80.27 
 
 		 220 aa  298  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  59.38 
 
 		 220 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  59.38 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  59.38 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  58.93 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  63.56 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  58.04 
 
 		 220 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  57.59 
 
 		 239 aa  234  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  49.35 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.91 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  35.15 
 
 		 267 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 		 266 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  37.5 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  36.97 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  36.79 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  36.79 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  36.79 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  36.79 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  36.79 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  46.28 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.61 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  44.8 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  43.09 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  45.38 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 187 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  45.95 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  48.62 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  49.52 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  46.79 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  37.59 
 
 		 367 aa  95.1  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  50.93 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.73 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  43.64 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.86 
 
 		 607 aa  92.8  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  47.47 
 
 		 320 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.73 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  47.52 
 
 		 321 aa  92  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  46.79 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  42.02 
 
 		 294 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.12 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  45.45 
 
 		 311 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  45.87 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.12 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 459 aa  89  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  44.44 
 
 		 310 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  44.44 
 
 		 310 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  44.44 
 
 		 310 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  44.44 
 
 		 310 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  44.44 
 
 		 310 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  44.44 
 
 		 310 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  44.44 
 
 		 310 aa  88.6  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.13 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  39.5 
 
 		 330 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  45.87 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  45.05 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.18 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  42.99 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  45.1 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  42.34 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 316 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.58 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 316 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  40.2 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  44.79 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  47.92 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  44.34 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.11 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.53 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  43 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  41.54 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  40.91 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>