More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5081 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  100 
 
 		 175 aa  341  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  88.57 
 
 		 175 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  66.07 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  64.88 
 
 		 191 aa  222  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  61.9 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  60.71 
 
 		 179 aa  194  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  46.51 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  47.09 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  46.51 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  46.51 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  46.51 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  46.51 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  46.51 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  46.51 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  41.42 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  38.73 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.63 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  35.8 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  36.21 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  36.42 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.84 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  36 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  37.29 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  37.14 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  36 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  36 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  37.14 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  37.43 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  33.53 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  36 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.27 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  36.16 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  37.43 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  35.47 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  33.53 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.43 
 
 		 189 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.84 
 
 		 186 aa  97.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.5 
 
 		 186 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  34.78 
 
 		 190 aa  94.4  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  32.16 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  36.61 
 
 		 203 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  31.02 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  35.36 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  30.48 
 
 		 222 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  37.21 
 
 		 206 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  33.53 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  36.99 
 
 		 181 aa  84.7  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  33.33 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.1 
 
 		 178 aa  84  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  36.84 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  32.8 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  32.22 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  37.72 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  27.17 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  31.84 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  30.64 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.94 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  36.52 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  32.54 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  33.14 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  36.78 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  27.84 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4038  cytochrome B561 protein  31.79 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  30.29 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.06 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  28.16 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  28.11 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  38.55 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  31.07 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  33.91 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  30.65 
 
 		 441 aa  77.8  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  30.86 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  26.29 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  31.76 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  35.23 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  28.74 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.74 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  36.16 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.74 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.74 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.74 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  30.41 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  28.74 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  28.74 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  35.36 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  32 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  30.06 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  31.82 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  36 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  35.67 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  35.67 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  33.14 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  35.67 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  35.67 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  35.67 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  35.67 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  29.82 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  31.18 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  35.67 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>