More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5015 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  95.88 
 
 
413 aa  839    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  95.64 
 
 
413 aa  840    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  87.8 
 
 
414 aa  775    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0478  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  85.96 
 
 
413 aa  772    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  87.89 
 
 
413 aa  782    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0835  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  86.2 
 
 
422 aa  773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2115  iron-sulphur Rieske protein  86.2 
 
 
413 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  95.87 
 
 
413 aa  839    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0747  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  86.2 
 
 
422 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1861  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  87.17 
 
 
413 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523473  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1578  iron-sulphur Rieske protein  84.06 
 
 
437 aa  751    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0999  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  85.96 
 
 
422 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75168  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  83.33 
 
 
437 aa  746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  95.4 
 
 
413 aa  839    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
413 aa  868    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  85.96 
 
 
422 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0635134  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  99.52 
 
 
413 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0703  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  85.96 
 
 
422 aa  773    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917605  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  95.4 
 
 
413 aa  839    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  88.24 
 
 
426 aa  780    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4057  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.92 
 
 
421 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296927  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  63.33 
 
 
419 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4003  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.02 
 
 
419 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.11239  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4043  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.77 
 
 
419 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  0.202366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3748  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.77 
 
 
419 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.219388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2476  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.3 
 
 
419 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.75426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1003  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.55 
 
 
423 aa  508  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.122707  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5289  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.53 
 
 
417 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.54502  normal  0.0949615 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4845  Rieske (2Fe-2S) domain protein  52.31 
 
 
417 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2853  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  50.72 
 
 
420 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6857  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.63 
 
 
418 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3689  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.36 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.88 
 
 
434 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4897  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.95 
 
 
410 aa  388  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.71235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.95 
 
 
414 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3219  Rieske (2Fe-2S) region  45.41 
 
 
408 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201195  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 
414 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1004  Rieske (2Fe-2S) protein  43.61 
 
 
445 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  45.12 
 
 
432 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.23 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.73 
 
 
430 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.73 
 
 
430 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.64 
 
 
423 aa  360  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  43.73 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1712  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.69 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.49 
 
 
430 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  43.24 
 
 
430 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_004310  BR1461  Rieske 2Fe-2S family protein  44.89 
 
 
405 aa  355  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1416  Rieske 2Fe-2S family protein  44.64 
 
 
405 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1189  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.27 
 
 
450 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.67 
 
 
412 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  43.48 
 
 
429 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.77 
 
 
430 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0981  ring hydroxylating dioxygenase alpha-subunit  44.77 
 
 
429 aa  352  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  43 
 
 
429 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.68 
 
 
424 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.95 
 
 
412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  41.75 
 
 
416 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.35 
 
 
414 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4029  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  43.04 
 
 
427 aa  339  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3978  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  41.28 
 
 
410 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0932  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.39 
 
 
418 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2069  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.39 
 
 
413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.17 
 
 
423 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3312  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 
408 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  30.85 
 
 
374 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  31.5 
 
 
380 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2498  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.88 
 
 
385 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0242656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3082  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.94 
 
 
373 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2506  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
385 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2461  Rieske (2Fe-2S) region  30.39 
 
 
385 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.197522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3044  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.5 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000332714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  29.43 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.37 
 
 
403 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.73 
 
 
432 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.3 
 
 
429 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.55 
 
 
374 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.55 
 
 
374 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  26.85 
 
 
434 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.55 
 
 
374 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1716  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.49 
 
 
466 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1660  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.49 
 
 
466 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1689  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.49 
 
 
466 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0537  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.49 
 
 
466 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689442  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5373  Rieske 2Fe-2S family protein  26.59 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0546  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.49 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4698  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.48 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.412068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.61 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.86 
 
 
376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
427 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  34.95 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3306  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.98 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478644  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.16 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6020  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 
382 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4738  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.590157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01772  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  33.8 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2528  Rieske 2Fe-2S domain protein  33.8 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0428403  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>