More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4960 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5031  major facilitator transporter  92.83 
 
 		 446 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6030  major facilitator transporter  80.22 
 
 		 443 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4960  major facilitator transporter  100 
 
 		 446 aa  884    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3336  major facilitator transporter  95.04 
 
 		 383 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00713075  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4440  major facilitator transporter  98.65 
 
 		 446 aa  868    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827136  hitchhiker  0.000980879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5253  major facilitator transporter  92.83 
 
 		 446 aa  749    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.841213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 434 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 448 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 448 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 448 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 434 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 434 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 434 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 434 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 437 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.31 
 
 		 437 aa  350  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 436 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 436 aa  349  7e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 443 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  43.48 
 
 		 442 aa  343  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 		 444 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 442 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 441 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 440 aa  339  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 443 aa  339  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  43 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  45.52 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  41.34 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  41.34 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 441 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.25 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  38.76 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  40.26 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 441 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 441 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 442 aa  328  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  41.09 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  41.09 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  41.09 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4586  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  43.86 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 441 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 439 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.09 
 
 		 439 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 445 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 		 452 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 449 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  41.99 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  41.87 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 		 430 aa  316  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  40.84 
 
 		 441 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  40.84 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  40.84 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  41.3 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  41.87 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  40.1 
 
 		 436 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 440 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 437 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>