20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4879 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4879  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  166  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00123249  hitchhiker  0.000000000134527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4362  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  166  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000152629  hitchhiker  0.000377592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0760  hypothetical protein  95.18 
 
 		 83 aa  158  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110621  decreased coverage  0.00000850392 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3436  hypothetical protein  95.18 
 
 		 83 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000239099  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4931  hypothetical protein  95.18 
 
 		 83 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000049187  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3687  hypothetical protein  91.57 
 
 		 83 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000507992  normal  0.538527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5356  hypothetical protein  92.77 
 
 		 82 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000567698  normal  0.0251464 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2199  hypothetical protein  83.33 
 
 		 87 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000443154  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1582  major surface protein 3  83.33 
 
 		 87 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.00000000246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0853  hypothetical protein  83.33 
 
 		 87 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00439999  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0946  hypothetical protein  83.33 
 
 		 87 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000169892  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0039  hypothetical protein  83.33 
 
 		 87 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000015275  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1770  major surface protein 3  80.77 
 
 		 87 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6950  hypothetical protein  63.29 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2991  hypothetical protein  59.52 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4261  hypothetical protein  60.71 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2116  hypothetical protein  52.87 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2133  hypothetical protein  57.14 
 
 		 91 aa  91.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0713  hypothetical protein  55.56 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1208  hypothetical protein  50.79 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>