More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4864 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  99.38 
 
 		 324 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  100 
 
 		 324 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  95.33 
 
 		 324 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  96.86 
 
 		 320 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  96.86 
 
 		 320 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  96.23 
 
 		 320 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  93.52 
 
 		 324 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  86.79 
 
 		 318 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  86.79 
 
 		 318 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  86.79 
 
 		 318 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  86.79 
 
 		 318 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  86.16 
 
 		 318 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  86.16 
 
 		 318 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  85.22 
 
 		 318 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  78.59 
 
 		 321 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  78.27 
 
 		 321 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  76.36 
 
 		 321 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  55.52 
 
 		 317 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  55.52 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  58.12 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  56.63 
 
 		 333 aa  341  8e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  57.56 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  56.13 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  54.84 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  53.99 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  52.7 
 
 		 330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  56.17 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  53.31 
 
 		 329 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  51.75 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  53.25 
 
 		 326 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  52.08 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 332 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  46.6 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  48.75 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  47 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  46.37 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 321 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 		 331 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 333 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.85 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  44.06 
 
 		 320 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  43.67 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  46.62 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  43.35 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  46.58 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  43.89 
 
 		 347 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  44.24 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  46.71 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  47.59 
 
 		 313 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  42.07 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  43.71 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  43.51 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  44.01 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  47.08 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  45.37 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 323 aa  235  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  43.49 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  44.41 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  43.46 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  43.46 
 
 		 318 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  42.54 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  43.11 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 314 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 335 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 335 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  39.79 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>