29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4776 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4776  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4252  hypothetical protein  95.61 
 
 		 114 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122458  decreased coverage  0.00323313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0832  hypothetical protein  87.72 
 
 		 114 aa  204  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3586  hypothetical protein  74.56 
 
 		 115 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284376  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3095  hypothetical protein  72.81 
 
 		 155 aa  166  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3060  hypothetical protein  72.81 
 
 		 155 aa  166  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2606  hypothetical protein  71.93 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2007  hypothetical protein  71.93 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.17329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0773  hypothetical protein  71.93 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3007  hypothetical protein  71.93 
 
 		 155 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0060  hypothetical protein  66.67 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4220  hypothetical protein  52.68 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1850  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1069  hypothetical protein  40.18 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.443207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4837  hypothetical protein  42.61 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2769  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1359  hypothetical protein  39.09 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.147484  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7213  hypothetical protein  36.04 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1177  hypothetical protein  32.71 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.174378  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1180  hypothetical protein  33.64 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1254  hypothetical protein  33.64 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2447  hypothetical protein  33.64 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.950659  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0400  hypothetical protein  35.14 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1236  hypothetical protein  32.73 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6596  hypothetical protein  32.73 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7085  hypothetical protein  31.82 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0138  hypothetical protein  29.82 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.096273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6200  hypothetical protein  32.73 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.484468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1695  hypothetical protein  35.65 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>