More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4463 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  296  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  98.01 
 
 		 151 aa  289  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  86.09 
 
 		 151 aa  258  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  86.09 
 
 		 151 aa  258  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  86.09 
 
 		 151 aa  258  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  84.77 
 
 		 151 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 147 aa  245  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  39.85 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 151 aa  88.6  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.31 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  42.66 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  37.88 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  41.23 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  44.04 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.33 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  39.36 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  37.59 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.67 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  34.86 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  40.95 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  41.24 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>