More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4441 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  76.67 
 
 
452 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  94.35 
 
 
425 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  76.67 
 
 
452 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  76.89 
 
 
497 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  77.11 
 
 
452 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  76.67 
 
 
452 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  92.94 
 
 
425 aa  827    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  90.82 
 
 
425 aa  791    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  92.71 
 
 
425 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  76.67 
 
 
452 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  78.65 
 
 
492 aa  710    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  94.35 
 
 
425 aa  837    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
425 aa  880    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  77.33 
 
 
452 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  98.82 
 
 
425 aa  872    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  94.35 
 
 
425 aa  837    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65.95 
 
 
427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  67.08 
 
 
427 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  65.99 
 
 
429 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5692  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  56.62 
 
 
428 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0139384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4612  cytochrome c, class I  56.36 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3756  cytochrome c, class I  56.36 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.91 
 
 
426 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.56 
 
 
474 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.38 
 
 
466 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.18 
 
 
469 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  47.48 
 
 
501 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.15 
 
 
426 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.99 
 
 
432 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  44.57 
 
 
432 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  46.72 
 
 
430 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.04 
 
 
422 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.25 
 
 
434 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.95 
 
 
432 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  44.95 
 
 
432 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  44.95 
 
 
432 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  46.06 
 
 
433 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  46.65 
 
 
434 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  46.25 
 
 
439 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  46.65 
 
 
434 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.76 
 
 
441 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.52 
 
 
447 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  45.66 
 
 
450 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  44.5 
 
 
439 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.29 
 
 
447 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3802  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.98 
 
 
455 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.503165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.74 
 
 
448 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  44.66 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.12 
 
 
434 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  44.77 
 
 
477 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  46.46 
 
 
434 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.08 
 
 
415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  45.86 
 
 
466 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.69 
 
 
453 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.07 
 
 
477 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.94 
 
 
475 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  44.94 
 
 
475 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  44.94 
 
 
475 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.47 
 
 
415 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  44.61 
 
 
437 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  42.43 
 
 
450 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  44.37 
 
 
439 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.39 
 
 
417 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.16 
 
 
417 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.19 
 
 
426 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.86 
 
 
454 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  44.69 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.63 
 
 
448 aa  326  6e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.54 
 
 
467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.7 
 
 
451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.39 
 
 
395 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.46 
 
 
469 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.91 
 
 
447 aa  316  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  42.86 
 
 
650 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43 
 
 
434 aa  315  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  42.61 
 
 
482 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  42.86 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.07 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  41.55 
 
 
473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.68 
 
 
439 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.83 
 
 
440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  38.97 
 
 
463 aa  310  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  42.72 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  41.2 
 
 
476 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.2 
 
 
432 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.03 
 
 
531 aa  306  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.86 
 
 
537 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  41.85 
 
 
527 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  41.85 
 
 
527 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.79 
 
 
531 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.25 
 
 
436 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  41.25 
 
 
436 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  41.25 
 
 
436 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.71 
 
 
451 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.33 
 
 
531 aa  299  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.19 
 
 
433 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  40.72 
 
 
728 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.92 
 
 
527 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  39.36 
 
 
407 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  40.1 
 
 
438 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>