More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4349 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  96.73 
 
 		 153 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  94.44 
 
 		 153 aa  285  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  94.44 
 
 		 170 aa  285  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  94.44 
 
 		 170 aa  285  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  90.28 
 
 		 170 aa  274  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  58.67 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  42.34 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 173 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  48.51 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  44.85 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.9 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.68 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.04 
 
 		 141 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  45.71 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  40.29 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  40.29 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  42.03 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  42.03 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  43.28 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.78 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  39.85 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  38.97 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.26 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 161 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  40 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 162 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  37.86 
 
 		 162 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 174 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  36.69 
 
 		 143 aa  97.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>