More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4216 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  90.53 
 
 		 380 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  86.32 
 
 		 380 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  99.74 
 
 		 380 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  91.58 
 
 		 379 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  88.95 
 
 		 380 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  91.84 
 
 		 380 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  100 
 
 		 380 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  76.92 
 
 		 411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  68.05 
 
 		 384 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  68.31 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  68.31 
 
 		 384 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  68.05 
 
 		 384 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  68.05 
 
 		 384 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  67.53 
 
 		 384 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  67.53 
 
 		 384 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  66.21 
 
 		 383 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  62.31 
 
 		 390 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  63.9 
 
 		 383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  61.92 
 
 		 383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  64.54 
 
 		 409 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  61.82 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  55.05 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  53.92 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.78 
 
 		 379 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  53.05 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  51.78 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.52 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  51.78 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  52.39 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  51.78 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.91 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  54.8 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  54.29 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.02 
 
 		 379 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51.12 
 
 		 381 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  50.38 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  50 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  51.12 
 
 		 381 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  50.53 
 
 		 379 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  52.03 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  51.52 
 
 		 384 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  49.22 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  48.45 
 
 		 375 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  47.5 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  47.5 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  47.5 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  47.5 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  47.5 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  47.5 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  47.5 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  47.94 
 
 		 375 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  47.37 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  47.94 
 
 		 375 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  47 
 
 		 414 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  49 
 
 		 392 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  49.18 
 
 		 375 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  49.36 
 
 		 377 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.36 
 
 		 377 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  49 
 
 		 387 aa  308  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  46.88 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.23 
 
 		 384 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  46.63 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  46.63 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.42 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.44 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.44 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.44 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.7 
 
 		 384 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  46.44 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  45.45 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.12 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.85 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  47.01 
 
 		 385 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.3 
 
 		 383 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  45.48 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  48.07 
 
 		 374 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  48.07 
 
 		 374 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  48.07 
 
 		 374 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  44.3 
 
 		 376 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  48.84 
 
 		 362 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  48.84 
 
 		 362 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  49.87 
 
 		 361 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  48.84 
 
 		 362 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  43.75 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  47.69 
 
 		 376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  47.69 
 
 		 376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  47.69 
 
 		 376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  47.69 
 
 		 376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  47.81 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.56 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  49.36 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  49.36 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  45.38 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.21 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  48.6 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.21 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  46.17 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.09 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  44.47 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>