More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4180 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  99.16 
 
 		 356 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  86.52 
 
 		 356 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  86.24 
 
 		 356 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  84.55 
 
 		 356 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  82.02 
 
 		 380 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4092  permease-like  85.11 
 
 		 385 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  65.92 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  65.63 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  65.63 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  65.63 
 
 		 356 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  65.63 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  65.63 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  65.63 
 
 		 356 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  66.1 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  64.56 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  61.7 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  61.18 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  46.29 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  49.25 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  48.97 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  42.05 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  48.39 
 
 		 359 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  48.44 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  45.51 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  35.04 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  34.77 
 
 		 354 aa  189  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  35.67 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  34.38 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  33.04 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  33.15 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  32.96 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  32.95 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  32.95 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  33.63 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  32.06 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  32.06 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  32.06 
 
 		 360 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  32.06 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 372 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  33.44 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  33.05 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  33.05 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  33.23 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  32.76 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  33.12 
 
 		 398 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  32.34 
 
 		 373 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  29.18 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  32.86 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  32.86 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  33.62 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  26.72 
 
 		 409 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  31.49 
 
 		 362 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  30.41 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  28.16 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  29.63 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  28.4 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  28.4 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  28.18 
 
 		 365 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  27.79 
 
 		 379 aa  122  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  27.94 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  31.36 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  28.57 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  27.83 
 
 		 348 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  28.33 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  30.06 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  30.14 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  28.33 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  28.33 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  28.33 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  28.33 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  28.33 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  28.33 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  28.33 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  27.91 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  30.28 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  25.93 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  29.57 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  27.71 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  30.41 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  29.57 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  27.61 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  29.94 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  25.07 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  26.72 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  29.71 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  30 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  30 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  26.11 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  30 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  30 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  27.22 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  31.27 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0988  hypothetical protein  39.89 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1102  protein of unknown function UPF0118  39.89 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  26.4 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  28.79 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  28.37 
 
 		 347 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  28.74 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>