58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3959 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3959  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3452  hypothetical protein  98.69 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.159434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4532  hypothetical protein  95.2 
 
 		 229 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2013  hypothetical protein  93.89 
 
 		 229 aa  427  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319899  normal  0.403491 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4307  hypothetical protein  94.32 
 
 		 229 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4059  hypothetical protein  94.32 
 
 		 229 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3466  hypothetical protein  94.32 
 
 		 229 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0933  hypothetical protein  81.66 
 
 		 229 aa  357  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1378  hypothetical protein  59.47 
 
 		 230 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0577  hypothetical protein  58.59 
 
 		 230 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0656  hypothetical protein  58.59 
 
 		 230 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2570  protein of unknown function DUF969  59.91 
 
 		 228 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1182  protein of unknown function DUF969  57.71 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0020  hypothetical protein  58.8 
 
 		 246 aa  254  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2480  hypothetical protein  59.63 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1217  hypothetical protein  53.46 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414254  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2151  hypothetical protein  51.98 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3085  hypothetical protein  52.23 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3118  hypothetical protein  51.54 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2168  hypothetical protein  53.15 
 
 		 239 aa  225  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.202836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2871  hypothetical protein  52.51 
 
 		 231 aa  224  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2846  permease  52.78 
 
 		 230 aa  224  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3099  hypothetical protein  52.78 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2879  hypothetical protein  52.78 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3094  hypothetical protein  52.78 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3117  hypothetical protein  52.05 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2807  permease  52.78 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3744  protein of unknown function DUF969  51.85 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.79738  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0090  hypothetical protein  54.34 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1170  hypothetical protein  53.7 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000118885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1118  hypothetical protein  53.7 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3592  hypothetical protein  53.7 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0192  hypothetical protein  50.93 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1258  hypothetical protein  53.24 
 
 		 243 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0785505  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0065  hypothetical protein  53.1 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1971  protein of unknown function DUF969  52.51 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.988199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3371  hypothetical protein  52.78 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0263  hypothetical protein  52.78 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0250  hypothetical protein  52.78 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2977  hypothetical protein  52.78 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.226934  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0446  hypothetical protein  52.78 
 
 		 338 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2114  hypothetical protein  52.78 
 
 		 352 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2371  protein of unknown function DUF969  52.05 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1601  normal  0.836703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2881  protein of unknown function DUF969  57.51 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0873  hypothetical protein  50.46 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5731  hypothetical protein  50.68 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195243  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3291  protein of unknown function DUF969  51.39 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0227  hypothetical protein  52.31 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0005  hypothetical protein  51.39 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2906  hypothetical protein  51.85 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0437  protein of unknown function DUF969  50.24 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000406355  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6525  protein of unknown function DUF969  48.15 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1372  hypothetical protein  41.43 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.157148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1680  hypothetical protein  41.78 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.936458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1415  hypothetical protein  40.85 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0773605  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0177  hypothetical protein  39.91 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000813125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1834  hypothetical protein  37.16 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.320572 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1237  protein of unknown function DUF969  29.17 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>