More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3867 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  76.95 
 
 
820 aa  1209    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.95 
 
 
856 aa  1210    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
819 aa  1655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.95 
 
 
856 aa  1210    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  92.73 
 
 
821 aa  1470    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  92.22 
 
 
821 aa  1434    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  77.01 
 
 
857 aa  1207    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  76.83 
 
 
820 aa  1223    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  70.34 
 
 
818 aa  1126    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  70.18 
 
 
820 aa  1120    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  91.98 
 
 
821 aa  1429    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  99.02 
 
 
822 aa  1635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  67.95 
 
 
828 aa  1109    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  91.98 
 
 
821 aa  1429    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  90.28 
 
 
821 aa  1449    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  77.07 
 
 
820 aa  1208    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.95 
 
 
820 aa  1209    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.95 
 
 
820 aa  1209    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3728  glycosyl transferase group 1  68.55 
 
 
397 aa  545  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0346462 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2502  glycosyl transferase, group 1 family protein  67.52 
 
 
413 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0300016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0632  glycosyl transferase, group 1  67.52 
 
 
413 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0032  glycosyl transferase, group 1 family protein  67.52 
 
 
413 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0810  glycosyl transferase, group 1 family protein  67.52 
 
 
413 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0314392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0647  glycosyl transferase, group 1 family protein  67.52 
 
 
413 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0524  glycosyl transferase, group 1 family protein  70.41 
 
 
414 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6735  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  70 
 
 
742 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2880  glycosyl transferase, group 1 family protein  67.52 
 
 
413 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.447923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2204  glycosyl transferase, group 1 family protein  67.52 
 
 
413 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2536  putative first mannosyl transferase,o- antigen biosynthesis  70.08 
 
 
407 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1810  glycosyl transferase, group 1  68.94 
 
 
416 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3127  glycosyl transferase, group 1  64.32 
 
 
380 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.020191  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1357  glycosyl transferase, group 1  64.78 
 
 
383 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.765434  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6748  glycosyl transferase group 1  63.84 
 
 
422 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1127  glycosyl transferase group 1  64.57 
 
 
402 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.353198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6492  glycosyl transferase, group 1  64.57 
 
 
402 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737986  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2264  glycosyl transferase, group 1  62.02 
 
 
385 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3448  glycosyl transferase, group 1 family protein  60.4 
 
 
409 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1680  glycosyl transferase group 1  60 
 
 
405 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3230  glycosyl transferase, group 1  61.52 
 
 
409 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1710  glycosyl transferase group 1  60.53 
 
 
398 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.586278  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1681  glycosyl transferase, group 1  60.33 
 
 
383 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  63.78 
 
 
402 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0294  aldehyde dehydrogenase  58.15 
 
 
374 aa  444  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4215  glycosyl transferase group 1  58.86 
 
 
374 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0733  glycosyl transferase group 1  56.19 
 
 
402 aa  435  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0519502  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  56.68 
 
 
389 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  56.13 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0836  glycosyl transferase group 1  52.36 
 
 
390 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.367499  normal  0.134682 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0496  glycosyl transferase, group 1  50.82 
 
 
371 aa  393  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1689  glycosyl transferase, group 1  54.3 
 
 
382 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  51.89 
 
 
364 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  51.23 
 
 
378 aa  386  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0349  glycosyl transferase, group 1  54.3 
 
 
398 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.329915 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  52.66 
 
 
363 aa  375  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2690  group 1 glycosyl transferase  49.34 
 
 
378 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.823218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3256  glycosyl transferase, group 1  48.66 
 
 
385 aa  363  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2100  glycosyl transferase, group 1  49.06 
 
 
381 aa  362  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  50 
 
 
468 aa  362  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3393  glycosyl transferase group 1  48.38 
 
 
378 aa  359  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3320  glycosyl transferase group 1  48.11 
 
 
386 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2781  glycosyl transferase group 1  48.11 
 
 
386 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0836  glycosyltransferase  46.7 
 
 
409 aa  327  6e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.260131  hitchhiker  0.000830652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20091  glycosyltransferase  45.81 
 
 
410 aa  316  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1553  glycosyltransferase  44.16 
 
 
415 aa  314  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451561  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13661  glycosyltransferase  43.46 
 
 
401 aa  314  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.244313  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  42.78 
 
 
369 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3401  glycosyl transferase group 1  42.23 
 
 
414 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0479  putative glycosyltransferase  46.13 
 
 
366 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3129  glycosyl transferase group 1  42.4 
 
 
414 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  43.19 
 
 
407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2594  glycosyl transferase, group 1  46.07 
 
 
399 aa  306  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0321424  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  43.19 
 
 
407 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  46.22 
 
 
361 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3532  glycosyl transferase group 1  44.78 
 
 
389 aa  300  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4558  glycosyl transferase group 1  42.6 
 
 
381 aa  294  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478096  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.59 
 
 
413 aa  292  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1037  putative glycosyltransferase group 1 family protein  41.97 
 
 
380 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2700  glycosyl transferase, group 1  41.54 
 
 
414 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  46.37 
 
 
389 aa  286  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3774  glycosyl transferase group 1  45.31 
 
 
372 aa  287  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3451  glycosyl transferase group 1  43.82 
 
 
412 aa  283  9e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0274  glycosyl transferase group 1  41.41 
 
 
378 aa  275  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  42.18 
 
 
378 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0859  glycosyl transferase group 1  42.68 
 
 
384 aa  274  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  41.88 
 
 
383 aa  270  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1177  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 
382 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 
360 aa  250  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4009  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 
361 aa  247  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
383 aa  242  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3665  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 
363 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1115  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 
362 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.282541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  47.25 
 
 
384 aa  226  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3126  group 1 glycosyl transferase  37.46 
 
 
366 aa  223  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.154017  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  41.69 
 
 
408 aa  213  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
372 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
372 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
372 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0414  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
363 aa  163  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3205  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
387 aa  153  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0019  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
370 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0112431  normal  0.0520774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>