More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3733 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  89.9 
 
 		 398 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  96.84 
 
 		 411 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  87.59 
 
 		 411 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  87.59 
 
 		 411 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  87.1 
 
 		 411 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  85.35 
 
 		 409 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  62.6 
 
 		 422 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  58.82 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  61.32 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  57.61 
 
 		 403 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  62.24 
 
 		 443 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  50.37 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  62.44 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  62.69 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  48.83 
 
 		 401 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  51.06 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  57.95 
 
 		 352 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 401 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  55.2 
 
 		 404 aa  316  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  47.87 
 
 		 401 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  53.59 
 
 		 405 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  47.82 
 
 		 414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  48.06 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 416 aa  299  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  53.95 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  59.89 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  59.69 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  48.38 
 
 		 408 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  52.28 
 
 		 402 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 402 aa  278  9e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 399 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 404 aa  268  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 385 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  44.75 
 
 		 409 aa  259  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.72 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.72 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.72 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.46 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  40.98 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 406 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 399 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.56 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 407 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.66 
 
 		 394 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.66 
 
 		 394 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  41.04 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  43.24 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  40.41 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  42.44 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.44 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  42.44 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  42.44 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  42.44 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  42.44 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  42.44 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  39.46 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 399 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  39.1 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  40.79 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.24 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.24 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1193  major facilitator superfamily MFS_1  51.27 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754311  normal  0.247806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  36.55 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 404 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 400 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  39.78 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3294  major facilitator family transporter  57.46 
 
 		 230 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.193712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2017  hypothetical protein  57.46 
 
 		 230 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 421 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 405 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  38.78 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  38.78 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>