More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3731 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  808    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  84.26 
 
 
394 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  95.94 
 
 
394 aa  776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  82.74 
 
 
394 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  84.01 
 
 
394 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  92.13 
 
 
394 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  95.93 
 
 
394 aa  774    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  98.98 
 
 
394 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  95.93 
 
 
394 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  95.93 
 
 
394 aa  774    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  84.01 
 
 
394 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  78.34 
 
 
411 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  76.2 
 
 
409 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  75.13 
 
 
409 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  55.76 
 
 
392 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.03 
 
 
390 aa  359  4e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  42.93 
 
 
400 aa  324  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  42.11 
 
 
378 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  45.95 
 
 
381 aa  302  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 
386 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  38.65 
 
 
370 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
382 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
377 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
372 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
382 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
375 aa  96.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.74 
 
 
419 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  36.12 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.47 
 
 
366 aa  94  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  31.03 
 
 
397 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  35.18 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.43 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
376 aa  93.6  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
391 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
434 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
439 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
357 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
377 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  30.87 
 
 
370 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  34.19 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
346 aa  90.9  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
439 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
439 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
386 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
386 aa  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
391 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
369 aa  89.4  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
380 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
370 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
363 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
452 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  30.33 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.33 
 
 
427 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
394 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
401 aa  87  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.56 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
392 aa  87  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
378 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
372 aa  86.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
394 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
388 aa  86.3  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  34.58 
 
 
384 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
383 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
411 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3923  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  29.96 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  31.56 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  34.59 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>