119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3709 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  99.48 
 
 		 194 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  90.21 
 
 		 194 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  90.21 
 
 		 194 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  90.21 
 
 		 194 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  90.72 
 
 		 194 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  86.6 
 
 		 194 aa  337  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  84.1 
 
 		 195 aa  327  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  84.1 
 
 		 195 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  80.83 
 
 		 195 aa  321  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  79.9 
 
 		 194 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  79.9 
 
 		 194 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  79.9 
 
 		 194 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  79.9 
 
 		 194 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  79.9 
 
 		 194 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  80.83 
 
 		 195 aa  318  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  80.83 
 
 		 195 aa  318  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  80.83 
 
 		 195 aa  318  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  80.83 
 
 		 195 aa  318  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  80.83 
 
 		 195 aa  318  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  80.83 
 
 		 195 aa  318  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  80.83 
 
 		 195 aa  318  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  79.9 
 
 		 194 aa  317  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  81.03 
 
 		 195 aa  317  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  80.85 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  80.85 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  84.53 
 
 		 195 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  68.39 
 
 		 195 aa  271  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  66.32 
 
 		 195 aa  269  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  67.36 
 
 		 195 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  62.56 
 
 		 195 aa  254  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  59.38 
 
 		 195 aa  234  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  65.7 
 
 		 195 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  64 
 
 		 195 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  59.79 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  58.67 
 
 		 198 aa  222  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  59.28 
 
 		 196 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  66.67 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  58.96 
 
 		 196 aa  208  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  56.25 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  50.52 
 
 		 192 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  53.01 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  50.76 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  56 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  53.23 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  53.71 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  49.47 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  53.85 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  44.03 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  48 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  39.38 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  41.72 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  52.94 
 
 		 167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  37.7 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  36.97 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  40.11 
 
 		 197 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  41.78 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  41.94 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  41.33 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  41.33 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  41.33 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  41.33 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  40.37 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  32.7 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  33.53 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  30.34 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  28.72 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  33.9 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  30.51 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  34.62 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  31.06 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  30.71 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  28.38 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  28.95 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  32.91 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  31.45 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  32.12 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  28.22 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  34.51 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  34.65 
 
 		 299 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  34.31 
 
 		 297 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  34.09 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  29.5 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  32.03 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  29.52 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  29.89 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  31.25 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  30.6 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  28.92 
 
 		 259 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  35.9 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  29.1 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  30.15 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>