More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3700 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 373 aa  744    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  50 
 
 		 363 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  48.48 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  48.73 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  49.03 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25.9 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.21 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.06 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  33 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 351 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 389 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 		 373 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 800 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 		 391 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  29.13 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  40.14 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 374 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.28 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  36.11 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  27.53 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  40.88 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 421 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.25 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  30.74 
 
 		 404 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 		 443 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 		 443 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  29.5 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  38.79 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 419 aa  99.8  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 		 350 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  39.56 
 
 		 426 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.69 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  35.17 
 
 		 935 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  31.52 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 421 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 748 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>