98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3659 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  346  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  45.81 
 
 
181 aa  140  1e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  133  2e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  133  2e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  4.78166e-07 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  42.17 
 
 
193 aa  130  7e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  37.57 
 
 
212 aa  129  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  40 
 
 
178 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  39.13 
 
 
189 aa  121  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3133  type VI secretion lipoprotein  34.19 
 
 
127 aa  78.2  5e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  34.71 
 
 
163 aa  73.2  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  34.71 
 
 
163 aa  73.2  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  34.71 
 
 
163 aa  73.2  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  34.71 
 
 
163 aa  73.2  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  27.27 
 
 
151 aa  66.6  1e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  32.03 
 
 
167 aa  67  1e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  38.3 
 
 
170 aa  66.2  2e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  31.25 
 
 
167 aa  65.9  2e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  35.79 
 
 
166 aa  64.7  5e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  37.14 
 
 
172 aa  64.7  6e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  31.4 
 
 
193 aa  64.7  6e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  30.5 
 
 
160 aa  64.3  8e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 
166 aa  63.9  9e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  33.64 
 
 
168 aa  63.9  1e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  33.64 
 
 
168 aa  63.5  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  27.95 
 
 
154 aa  63.2  2e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  33.01 
 
 
163 aa  62  4e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  28.66 
 
 
181 aa  61.2  7e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  27.27 
 
 
166 aa  60.8  9e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  34.58 
 
 
154 aa  60.1  1e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58047e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  39.58 
 
 
167 aa  58.9  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  39.58 
 
 
167 aa  58.9  3e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  39.58 
 
 
167 aa  58.9  3e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  39.58 
 
 
167 aa  58.9  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  35.96 
 
 
168 aa  58.5  5e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  26.53 
 
 
162 aa  57.8  7e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  26.22 
 
 
202 aa  57.8  7e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  26.92 
 
 
180 aa  57.8  7e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  35.94 
 
 
168 aa  57.8  7e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  30 
 
 
204 aa  57.4  9e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  30 
 
 
204 aa  57.4  9e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  30 
 
 
200 aa  57.4  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  29.23 
 
 
251 aa  57.4  1e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  31.68 
 
 
292 aa  56.2  2e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  27.27 
 
 
156 aa  56.6  2e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  45.21 
 
 
167 aa  55.5  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  32.88 
 
 
210 aa  55.8  3e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.03231e-07  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  45.21 
 
 
167 aa  55.5  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  45.21 
 
 
167 aa  55.5  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  29.09 
 
 
177 aa  55.5  3e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  27.41 
 
 
240 aa  55.5  4e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  24.18 
 
 
179 aa  55.1  5e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  30 
 
 
171 aa  55.1  5e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  27.41 
 
 
240 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  27.41 
 
 
240 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  33.67 
 
 
207 aa  53.9  1e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  27.41 
 
 
240 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  30.08 
 
 
171 aa  52.8  3e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  28.95 
 
 
210 aa  51.2  7e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  29.61 
 
 
180 aa  51.2  7e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  50.8  9e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  35.29 
 
 
197 aa  50.4  1e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.78046e-06 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  27.97 
 
 
180 aa  50.4  1e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  26.26 
 
 
192 aa  50.1  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  24.63 
 
 
158 aa  50.4  1e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  28.33 
 
 
187 aa  49.7  2e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  29.27 
 
 
172 aa  49.3  2e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  29.27 
 
 
191 aa  49.3  2e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  29.27 
 
 
179 aa  49.3  2e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  29.27 
 
 
172 aa  49.3  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  29.27 
 
 
172 aa  49.3  2e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  29.27 
 
 
172 aa  49.3  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  29.27 
 
 
172 aa  49.3  2e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  29.6 
 
 
199 aa  49.3  3e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  29.89 
 
 
155 aa  48.5  4e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  26.12 
 
 
163 aa  48.5  4e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  25.9 
 
 
164 aa  48.5  5e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  28.79 
 
 
154 aa  47.4  9e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  30 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.22 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  28.79 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  22.09 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  21.38 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  30 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  30.12 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  21.47 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  26.36 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  30.12 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  28.71 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  30.12 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  33.7 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  30.12 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  24.59 
 
 
190 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  30.12 
 
 
202 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  24.32 
 
 
186 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  24.04 
 
 
176 aa  40.8  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  24.32 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  24.32 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>