More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3644 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2798  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.24 
 
 		 872 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.425597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  56.63 
 
 		 882 aa  962    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  49.83 
 
 		 875 aa  736    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  56.66 
 
 		 882 aa  968    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  44.87 
 
 		 866 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  46.52 
 
 		 878 aa  697    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  100 
 
 		 902 aa  1797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  45.55 
 
 		 887 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  47.15 
 
 		 842 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  47.02 
 
 		 905 aa  701    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  45.75 
 
 		 889 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  46.35 
 
 		 889 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  43.02 
 
 		 867 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  45.03 
 
 		 882 aa  682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  45.62 
 
 		 928 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  51.65 
 
 		 875 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  47.86 
 
 		 889 aa  725    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.22 
 
 		 884 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  47.57 
 
 		 897 aa  729    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.22 
 
 		 884 aa  663    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  56.55 
 
 		 880 aa  967    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  42.87 
 
 		 891 aa  678    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  44.75 
 
 		 863 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  46.56 
 
 		 867 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  47.86 
 
 		 889 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.61 
 
 		 899 aa  699    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.59 
 
 		 898 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  46.8 
 
 		 865 aa  713    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  59.87 
 
 		 913 aa  1000    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  46.55 
 
 		 882 aa  717    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  47.24 
 
 		 889 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0395  type VI secretion ATPase  44.21 
 
 		 867 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  47.86 
 
 		 889 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  46.09 
 
 		 888 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  45.67 
 
 		 918 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.93 
 
 		 910 aa  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  47.84 
 
 		 904 aa  690    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  47.42 
 
 		 886 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  45.29 
 
 		 900 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  44.64 
 
 		 885 aa  695    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  45.75 
 
 		 889 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  51.29 
 
 		 899 aa  809    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  47.07 
 
 		 889 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  44.86 
 
 		 893 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  46.42 
 
 		 887 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0322  type VI secretion ATPase  44.32 
 
 		 867 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  49.94 
 
 		 878 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  47.86 
 
 		 889 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.77 
 
 		 909 aa  717    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  45.64 
 
 		 916 aa  689    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  45.9 
 
 		 889 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  45.41 
 
 		 918 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  46.04 
 
 		 885 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.1 
 
 		 887 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.32 
 
 		 888 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  47.46 
 
 		 887 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  56.88 
 
 		 880 aa  973    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  42.65 
 
 		 885 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  45.89 
 
 		 906 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  47.06 
 
 		 891 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  43.22 
 
 		 897 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  45.44 
 
 		 895 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  44.63 
 
 		 916 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  47.52 
 
 		 889 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.22 
 
 		 884 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  44.57 
 
 		 894 aa  748    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  46.69 
 
 		 889 aa  706    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  45.67 
 
 		 895 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  59.58 
 
 		 893 aa  1009    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  44.67 
 
 		 902 aa  707    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  54.97 
 
 		 884 aa  901    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  46.86 
 
 		 865 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  47.86 
 
 		 889 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.7 
 
 		 908 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  45.32 
 
 		 879 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  56.25 
 
 		 881 aa  941    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  44.99 
 
 		 887 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  55.39 
 
 		 884 aa  971    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  44.16 
 
 		 868 aa  698    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  46.91 
 
 		 889 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.09 
 
 		 888 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  45.65 
 
 		 897 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  44.2 
 
 		 902 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.35 
 
 		 903 aa  661    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  50.21 
 
 		 877 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  46.36 
 
 		 893 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  47.35 
 
 		 889 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  45.02 
 
 		 915 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  45.43 
 
 		 879 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  44.44 
 
 		 909 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  42.65 
 
 		 885 aa  674    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  43.79 
 
 		 895 aa  673    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.98 
 
 		 906 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  45.32 
 
 		 879 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  44.83 
 
 		 898 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  45.56 
 
 		 901 aa  647    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.22 
 
 		 884 aa  663    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  47.57 
 
 		 897 aa  729    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  46.73 
 
 		 865 aa  698    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  56.51 
 
 		 880 aa  961    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>