81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3538 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  225  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  93.86 
 
 		 114 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  87.61 
 
 		 115 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  87.61 
 
 		 116 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  86.24 
 
 		 115 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  66.67 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  66.29 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  64.58 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0305  hypothetical protein  65.56 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  62.22 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  62.5 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  56.18 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3208  hypothetical protein  60.71 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0779  hypothetical protein  58.7 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.474685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  58.33 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2332  hypothetical protein  55.95 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376166  normal  0.710441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0253  hypothetical protein  52.17 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0050  hypothetical protein  55.68 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0153  hypothetical protein  51.09 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  52.69 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  52.58 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  46.74 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  52.58 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  52.08 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4436  hypothetical protein  49 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  34.31 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  38.1 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  41.77 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  41.86 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.05 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  38.1 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  38.1 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  38.1 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  46.58 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  38.1 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.9 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35.71 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  36.05 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.9 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.65 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  38.96 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  35.44 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  34.88 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.56 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  33.75 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  33.75 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  38.67 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.19 
 
 		 452 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  35.06 
 
 		 469 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.57 
 
 		 452 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  37.18 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  41.33 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  34.18 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 		 429 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  32.93 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  37.66 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  37.66 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  37.66 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  37.97 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  29.55 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  36.14 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 983 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.53 
 
 		 429 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  35.71 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  35.44 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  37.78 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.53 
 
 		 429 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  33.72 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 		 591 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.11 
 
 		 478 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.54 
 
 		 986 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  29.76 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3516  ferredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641626  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  39.44 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  40.43 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  35.21 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  32.88 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  35.06 
 
 		 788 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>