More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3536 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  98.17 
 
 		 382 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 382 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  91.64 
 
 		 383 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  91.64 
 
 		 383 aa  685    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  88.77 
 
 		 383 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  79.29 
 
 		 375 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  75.96 
 
 		 383 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  79.02 
 
 		 375 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  57.98 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  56.71 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  54.4 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  57.61 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  55.7 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  55.14 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  57.14 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  52.85 
 
 		 378 aa  326  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  49.46 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  44.95 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  46.28 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  45.21 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  45.68 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  45.56 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  45.23 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  44.14 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  37.33 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  33.33 
 
 		 377 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 500 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 983 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 984 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 500 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.99 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 960 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 395 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  26.34 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  26.34 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  26.34 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  26.34 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  26.34 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 492 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 444 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  26.09 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  26.34 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.92 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  25.46 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.07 
 
 		 417 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  29.24 
 
 		 441 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.42 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.71 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  29.79 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 441 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.14 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.14 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>