More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3400 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  89.3 
 
 		 429 aa  754    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  95.12 
 
 		 429 aa  791    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  95.12 
 
 		 430 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  96.05 
 
 		 430 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  855    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  99.3 
 
 		 430 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  96.05 
 
 		 430 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  58.88 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  54.67 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 		 439 aa  451  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 		 436 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  49.3 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  50.45 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  51.42 
 
 		 426 aa  418  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  46.5 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  50.72 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  46.03 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 		 431 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 445 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  38.8 
 
 		 480 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  39.3 
 
 		 439 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  38.76 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  38.28 
 
 		 441 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  38 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  37.53 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 479 aa  303  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  41.3 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 432 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 409 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 411 aa  292  6e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 428 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  37.71 
 
 		 434 aa  265  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  34.12 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 440 aa  237  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 425 aa  236  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  31.59 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  33.09 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  31.51 
 
 		 425 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  31.51 
 
 		 425 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 430 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 427 aa  206  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  31.1 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  32.04 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 432 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  29.7 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  29.7 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  29.7 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  29.7 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  29.7 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  30.86 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  31.08 
 
 		 472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  31.08 
 
 		 472 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  31.08 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.52 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  30.52 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  31.08 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.52 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 415 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  32.19 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  31.08 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  31.08 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  31.08 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  31.08 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  31.08 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  28.37 
 
 		 432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 438 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.62 
 
 		 446 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>