92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3367 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
85 aa  171  4e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  97.65 
 
 
85 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  4.29039e-05  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  70.93 
 
 
90 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  63.95 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  58.62 
 
 
87 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  58.62 
 
 
87 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  60.47 
 
 
87 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  58.62 
 
 
87 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  59.3 
 
 
87 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  59.3 
 
 
87 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  60.47 
 
 
87 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  60.47 
 
 
87 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  58.62 
 
 
87 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  48.78 
 
 
86 aa  79.7  1e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  48.84 
 
 
88 aa  73.6  9e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  45.57 
 
 
453 aa  70.9  5e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  48.72 
 
 
101 aa  70.1  9e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  48.72 
 
 
88 aa  69.7  1e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  48.72 
 
 
88 aa  69.7  1e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  46.51 
 
 
88 aa  67.4  6e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  50.62 
 
 
88 aa  67.4  7e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  48.68 
 
 
86 aa  65.5  2e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  49.41 
 
 
87 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  43.9 
 
 
88 aa  62.8  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  62.8  1e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  62.8  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  62.8  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  62.8  1e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  63.2  1e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  43.9 
 
 
88 aa  63.2  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  42.68 
 
 
86 aa  63.2  1e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  43.9 
 
 
83 aa  62  2e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0004  PAAR repeat-containing protein  45.21 
 
 
134 aa  62  3e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0248137  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 
83 aa  61.6  3e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  46.15 
 
 
86 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  41.98 
 
 
89 aa  60.1  9e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  43.9 
 
 
83 aa  59.7  1e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  42.47 
 
 
88 aa  59.7  1e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  44.3 
 
 
88 aa  59.3  2e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  43.9 
 
 
83 aa  58.9  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  41.25 
 
 
188 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  39.02 
 
 
87 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  38.55 
 
 
93 aa  57.8  5e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  45.57 
 
 
87 aa  57.8  5e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0016  PAAR  42.68 
 
 
86 aa  57.8  5e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 
83 aa  57  7e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 
83 aa  57.4  7e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  40.24 
 
 
92 aa  56.2  1e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  41.03 
 
 
88 aa  56.2  1e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1796  PAAR repeat-containing protein  38.1 
 
 
85 aa  55.1  3e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.618362 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  39.02 
 
 
94 aa  55.1  3e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  37.8 
 
 
102 aa  54.7  4e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  39.51 
 
 
194 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  36.9 
 
 
94 aa  54.3  5e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  40.23 
 
 
89 aa  53.9  6e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  40.96 
 
 
84 aa  54.3  6e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  35.44 
 
 
93 aa  53.5  9e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  42.5 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  45.33 
 
 
137 aa  51.6  4e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  36.36 
 
 
87 aa  50.4  9e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  37.18 
 
 
86 aa  49.7  1e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  38.96 
 
 
87 aa  49.7  1e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3180  hypothetical protein  41.33 
 
 
84 aa  48.9  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.137745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  34.18 
 
 
92 aa  49.3  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  43.06 
 
 
133 aa  49.3  2e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  31.65 
 
 
92 aa  48.1  4e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  39.33 
 
 
152 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  39.74 
 
 
131 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  39.29 
 
 
91 aa  47.8  5e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  37.66 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  37.97 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  37.97 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  37.97 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  44.3 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  36.71 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  36.25 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  37.04 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  37.04 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  37.04 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  43.21 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  37.04 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  37.97 
 
 
512 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  37.97 
 
 
510 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  37.8 
 
 
141 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  37.97 
 
 
510 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  35.44 
 
 
178 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  39.19 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  43.4 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  5.63624e-08  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  40.74 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  40.74 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  36 
 
 
89 aa  40  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>