51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3303 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 167 aa  347  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  95.21 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  95.21 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  95.21 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  92.22 
 
 		 167 aa  328  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  89.82 
 
 		 166 aa  294  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  80.24 
 
 		 166 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  83.44 
 
 		 156 aa  278  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  76.05 
 
 		 166 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  76.05 
 
 		 166 aa  270  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  75.45 
 
 		 166 aa  268  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  53.85 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  56.3 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  38.56 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  36.88 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  33.54 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  33.14 
 
 		 176 aa  94.4  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  40.16 
 
 		 184 aa  94  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  38.62 
 
 		 166 aa  90.5  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  34.06 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  33.12 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  36.23 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  34.85 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.75 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  31.88 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  31.55 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  30.49 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  31.65 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  30 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  27.5 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  26.74 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  31.3 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  30.29 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  31.3 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  28.06 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  28.06 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  30.22 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  29.03 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  29.36 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  31.08 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  28.95 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  29.68 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  32.91 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  28.47 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4188  hypothetical protein  26.25 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.62 
 
 		 501 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  27.87 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  24.6 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  31.48 
 
 		 257 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  31.46 
 
 		 233 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>