More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3302 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0955  putative two-component regulator histidine sensor kinase  66.06 
 
 		 602 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3302  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 606 aa  1219    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  90.59 
 
 		 606 aa  1097    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  77.06 
 
 		 601 aa  878    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0633  MmoS, putative  67.05 
 
 		 602 aa  809    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  94.09 
 
 		 610 aa  1157    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  94.09 
 
 		 610 aa  1157    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  86.3 
 
 		 603 aa  1047    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0794  sensory box histidine kinase/response regulator  65.89 
 
 		 602 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  94.09 
 
 		 610 aa  1157    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  65.89 
 
 		 611 aa  799    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 608 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 613 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 607 aa  250  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4735  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 594 aa  229  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 813 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  33.08 
 
 		 1364 aa  174  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  32.15 
 
 		 2051 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1120 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1029 aa  170  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 664 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 663 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4054  histidine kinase  28.43 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  29.35 
 
 		 1060 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 913 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 		 865 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 641 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 957 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 974 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  28.22 
 
 		 882 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 1261 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1433 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.34 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 784 aa  160  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 947 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 781 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  32.73 
 
 		 1001 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 695 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.07 
 
 		 1331 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 1363 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 524 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  30.5 
 
 		 806 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1603 aa  158  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  31.33 
 
 		 550 aa  158  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 907 aa  158  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 1323 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  28.85 
 
 		 676 aa  157  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 815 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 781 aa  157  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.12 
 
 		 784 aa  156  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 846 aa  156  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 1305 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 898 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  30.08 
 
 		 984 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0100  histidine kinase  24.37 
 
 		 572 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102093  normal  0.549311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 721 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  29.77 
 
 		 630 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 1352 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  30.17 
 
 		 666 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 770 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 829 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 		 572 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 912 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 		 995 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  30.21 
 
 		 589 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  31.13 
 
 		 710 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 1214 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  29.52 
 
 		 630 aa  154  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 808 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  29.95 
 
 		 742 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 662 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 808 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 		 782 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 877 aa  154  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 1287 aa  153  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 785 aa  153  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 1791 aa  153  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1977  histidine kinase  31.69 
 
 		 534 aa  153  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.313704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 		 1070 aa  153  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 768 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 		 893 aa  153  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  34.12 
 
 		 1323 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 811 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 		 1146 aa  153  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 597 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 768 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 		 1002 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 654 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  30.26 
 
 		 578 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 		 1154 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  31.51 
 
 		 900 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01510  two-component system sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 813 aa  152  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.683286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  28.87 
 
 		 1028 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 925 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 672 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  34 
 
 		 1361 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 768 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 656 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  27.75 
 
 		 968 aa  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 768 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>