104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3025 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  79.44 
 
 
179 aa  285  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  63.07 
 
 
180 aa  234  5e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  61.45 
 
 
180 aa  233  1e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  61.45 
 
 
210 aa  232  2e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  41.51 
 
 
172 aa  150  6e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  44.38 
 
 
163 aa  147  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  44.38 
 
 
163 aa  147  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  44.38 
 
 
163 aa  146  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  44.38 
 
 
163 aa  146  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  50.32 
 
 
167 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  47.4 
 
 
166 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  46.36 
 
 
167 aa  141  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  45.22 
 
 
170 aa  139  2e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  45.89 
 
 
168 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  43.14 
 
 
168 aa  128  4e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  44.44 
 
 
167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  44.44 
 
 
167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  44.44 
 
 
167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  44.44 
 
 
167 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  45.19 
 
 
167 aa  110  1e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  45.19 
 
 
167 aa  110  1e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  45.19 
 
 
167 aa  110  1e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  40.62 
 
 
179 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  40.62 
 
 
172 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  40.62 
 
 
172 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  40.62 
 
 
191 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  40.62 
 
 
172 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  40.62 
 
 
172 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  40.62 
 
 
172 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  37.24 
 
 
192 aa  101  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  45.19 
 
 
166 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  44.23 
 
 
166 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  40.17 
 
 
160 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  40.62 
 
 
171 aa  97.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  41.44 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  39.66 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  32 
 
 
162 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  35.61 
 
 
168 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  35.61 
 
 
168 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  33.96 
 
 
155 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  32.82 
 
 
154 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  41.58 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  32.82 
 
 
154 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  34.84 
 
 
199 aa  84  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  33.65 
 
 
163 aa  81.6  6e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  34.53 
 
 
171 aa  80.9  8e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  33.9 
 
 
151 aa  80.9  1e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  36.19 
 
 
156 aa  79.7  2e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  37.36 
 
 
197 aa  75.1  5e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.78046e-06 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  33.33 
 
 
176 aa  73.6  2e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  38.21 
 
 
157 aa  71.2  7e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  31.4 
 
 
164 aa  70.9  1e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  26.77 
 
 
186 aa  68.6  4e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  26.77 
 
 
179 aa  68.6  5e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  26.77 
 
 
179 aa  68.6  5e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  32.32 
 
 
149 aa  61.6  5e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  28.93 
 
 
154 aa  61.2  8e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  28.67 
 
 
158 aa  60.5  1e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  31.13 
 
 
212 aa  60.1  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  29.82 
 
 
156 aa  59.7  2e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  28.24 
 
 
166 aa  57.8  8e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  30.85 
 
 
172 aa  54.3  8e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  26.89 
 
 
202 aa  54.3  9e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  30.3 
 
 
251 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  30.81 
 
 
150 aa  52.4  3e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  27.68 
 
 
292 aa  52.4  3e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  27.68 
 
 
204 aa  52.4  3e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  27.68 
 
 
204 aa  52.4  3e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  32.95 
 
 
163 aa  52  4e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  27.68 
 
 
200 aa  52.4  4e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  27.83 
 
 
190 aa  51.6  6e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3128  hypothetical protein  29.65 
 
 
150 aa  51.2  8e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  3.51189e-05  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  31.3 
 
 
164 aa  50.8  9e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  26.55 
 
 
154 aa  50.8  9e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58047e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  31.07 
 
 
265 aa  48.1  7e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  26.13 
 
 
177 aa  48.1  7e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  31.07 
 
 
265 aa  47.8  8e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  27.27 
 
 
189 aa  47.8  8e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  25.53 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  25.42 
 
 
176 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  27.45 
 
 
193 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  28.57 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  26.47 
 
 
193 aa  44.3  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  26.47 
 
 
193 aa  44.3  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  4.78166e-07 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  28.24 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  28.24 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  26.67 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  28.24 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.11 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.03231e-07  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  28.24 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  28.24 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  28 
 
 
240 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  25.77 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  27.75 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  28.24 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  27.18 
 
 
265 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  27.18 
 
 
265 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  25.71 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>