41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3010 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  100 
 
 		 284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  83.51 
 
 		 286 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  68.9 
 
 		 284 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  71.27 
 
 		 268 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  71.27 
 
 		 268 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  70.9 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  51.91 
 
 		 275 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  44.81 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  46.27 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  43.75 
 
 		 268 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  43.75 
 
 		 268 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  43.36 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  42.18 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  44.08 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  44.04 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  43.32 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  43.32 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  44.04 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  42 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  42 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  42 
 
 		 321 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  41.33 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  41.33 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  41.33 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  41.33 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  39.77 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  40.23 
 
 		 269 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  41.13 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  40.75 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  40.71 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  38.4 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  34.46 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  36.93 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  33.33 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  30.07 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  29.88 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  27.96 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  32.78 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  28.51 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  27.48 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3028  virulence protein, SciE type  27.84 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0281455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>