50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2912 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  79.46 
 
 
224 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  76.34 
 
 
224 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  76.34 
 
 
224 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  76.34 
 
 
224 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  70.98 
 
 
224 aa  298  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  69.2 
 
 
228 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  69.2 
 
 
228 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  69.2 
 
 
224 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  69.2 
 
 
224 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  69.2 
 
 
224 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  69.2 
 
 
224 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  69.2 
 
 
224 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  62.84 
 
 
223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  63.08 
 
 
221 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  62.33 
 
 
218 aa  269  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  62.33 
 
 
218 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  62.33 
 
 
218 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  57.92 
 
 
219 aa  262  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  65.12 
 
 
220 aa  261  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  61.27 
 
 
219 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  62.5 
 
 
225 aa  251  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  59.31 
 
 
219 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  55.19 
 
 
221 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  57.14 
 
 
219 aa  246  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  56.22 
 
 
219 aa  234  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  57.49 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  56.46 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  65.87 
 
 
169 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  52.66 
 
 
220 aa  211  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  53.59 
 
 
219 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  42.86 
 
 
225 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  49.76 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  38.99 
 
 
224 aa  150  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  36 
 
 
231 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  34 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  35 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  31.94 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  32.8 
 
 
202 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  33.52 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  30.81 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  29.69 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  27.41 
 
 
196 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  31.47 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  28.48 
 
 
195 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  28.86 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  30.15 
 
 
199 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  25 
 
 
449 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  30.33 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1121  hypothetical protein  26.5 
 
 
196 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00601274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>