More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2773 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  278  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  99.29 
 
 
140 aa  277  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  98.57 
 
 
140 aa  276  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  98.57 
 
 
140 aa  276  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  98.57 
 
 
140 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  95.71 
 
 
140 aa  270  4e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  95 
 
 
140 aa  267  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  80 
 
 
135 aa  221  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  80 
 
 
135 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  78.72 
 
 
161 aa  221  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  80 
 
 
135 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  76.6 
 
 
141 aa  220  5e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  79.26 
 
 
135 aa  219  1e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  79.26 
 
 
135 aa  219  1e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  79.26 
 
 
135 aa  219  1e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  79.26 
 
 
135 aa  219  1e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  79.26 
 
 
135 aa  219  1e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  75.89 
 
 
141 aa  218  2e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  55.71 
 
 
151 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  54.01 
 
 
137 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  56.43 
 
 
140 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  54.29 
 
 
140 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
137 aa  116  1e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  45.65 
 
 
137 aa  116  1e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  39.86 
 
 
141 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 
135 aa  112  2e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  40.44 
 
 
135 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
135 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.71 
 
 
135 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  43.65 
 
 
128 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  42.65 
 
 
135 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  42.19 
 
 
138 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  41.61 
 
 
136 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  46.3 
 
 
145 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  36.15 
 
 
141 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  33.81 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
135 aa  96.7  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  41.43 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  44.44 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  38.69 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  33.81 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  43.38 
 
 
135 aa  94.4  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  40.94 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  37.01 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.37 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
146 aa  87  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35.71 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  38.46 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  33.09 
 
 
141 aa  85.9  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  3.98103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  34.56 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 
145 aa  83.2  1e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  34.11 
 
 
144 aa  82  2e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 
143 aa  82  2e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  34.11 
 
 
141 aa  82  2e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 
143 aa  81.6  3e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  32.35 
 
 
144 aa  81.6  3e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  38.24 
 
 
143 aa  80.9  5e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
143 aa  80.9  5e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  38.24 
 
 
143 aa  80.9  5e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
143 aa  80.9  5e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  38.24 
 
 
143 aa  80.9  5e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
143 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
143 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  35.04 
 
 
143 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  35.04 
 
 
143 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 
143 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  35.04 
 
 
143 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  35.04 
 
 
143 aa  80.5  7e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  35.04 
 
 
143 aa  80.5  7e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  33.33 
 
 
144 aa  80.5  8e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 
143 aa  80.1  1e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 
151 aa  80.1  1e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  36.89 
 
 
130 aa  79.3  2e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
144 aa  77.8  4e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  34.31 
 
 
141 aa  77.4  5e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
170 aa  77.4  6e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  29.08 
 
 
142 aa  77.4  6e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
143 aa  77.4  6e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  37 
 
 
148 aa  77  8e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  30.5 
 
 
144 aa  76.6  9e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63421e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  30.5 
 
 
158 aa  76.6  1e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03873e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 
143 aa  76.3  1e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 
145 aa  76.6  1e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 
144 aa  76.6  1e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  31.21 
 
 
144 aa  76.6  1e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
143 aa  76.3  1e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
144 aa  76.3  1e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
149 aa  75.5  2e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  30.5 
 
 
144 aa  75.5  2e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 
138 aa  75.5  2e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 
144 aa  75.5  2e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
149 aa  75.1  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 
144 aa  75.1  3e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
137 aa  75.1  3e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  36.19 
 
 
149 aa  74.7  4e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>