More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2763 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  68.1 
 
 
531 aa  751    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  71.21 
 
 
529 aa  743    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  81.13 
 
 
547 aa  858    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  67.77 
 
 
541 aa  717    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  68.33 
 
 
536 aa  721    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  86.17 
 
 
534 aa  924    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  69.85 
 
 
530 aa  738    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  68.61 
 
 
536 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  71 
 
 
540 aa  756    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  67.66 
 
 
543 aa  727    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  67.54 
 
 
530 aa  744    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  78.12 
 
 
569 aa  815    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  72.18 
 
 
527 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  69.25 
 
 
527 aa  746    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  98.69 
 
 
535 aa  1058    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  68.1 
 
 
530 aa  746    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  96.82 
 
 
535 aa  1040    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  96.82 
 
 
535 aa  1040    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  63.65 
 
 
538 aa  709    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  63.65 
 
 
538 aa  709    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1470  cytochrome c oxidase, subunit I  60.23 
 
 
531 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  86.17 
 
 
534 aa  907    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  68.1 
 
 
530 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  67.91 
 
 
530 aa  745    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  71.01 
 
 
529 aa  741    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0315  cytochrome-c oxidase  86.13 
 
 
534 aa  870    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
535 aa  1068    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  71.92 
 
 
526 aa  760    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  81.32 
 
 
544 aa  856    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  71.6 
 
 
530 aa  740    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  69.27 
 
 
546 aa  738    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  68.03 
 
 
534 aa  744    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  96.82 
 
 
535 aa  1040    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  79.69 
 
 
531 aa  869    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3046  cytochrome c oxidase  65.33 
 
 
532 aa  685    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000491174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  71.01 
 
 
530 aa  740    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  68.44 
 
 
540 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  71.4 
 
 
529 aa  743    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  98.88 
 
 
535 aa  1058    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  68.1 
 
 
530 aa  746    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  82.88 
 
 
543 aa  882    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  96.82 
 
 
535 aa  1040    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  79.3 
 
 
544 aa  831    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  61.05 
 
 
550 aa  664    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  99.44 
 
 
535 aa  1064    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  81.9 
 
 
535 aa  888    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  76.07 
 
 
526 aa  773    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  96.64 
 
 
535 aa  1038    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  74.72 
 
 
529 aa  786    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  96.82 
 
 
535 aa  1040    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  70.1 
 
 
534 aa  740    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  82.1 
 
 
544 aa  859    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  79.69 
 
 
531 aa  869    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  96.82 
 
 
535 aa  1040    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  86.17 
 
 
534 aa  907    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  79.65 
 
 
544 aa  833    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  81.36 
 
 
556 aa  863    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  78.86 
 
 
539 aa  840    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  69.56 
 
 
516 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  79.58 
 
 
544 aa  838    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  65.92 
 
 
534 aa  711    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  94.6 
 
 
537 aa  1018    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  96.82 
 
 
535 aa  1040    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  68.46 
 
 
535 aa  753    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  66.09 
 
 
535 aa  703    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  86.33 
 
 
536 aa  895    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  81.82 
 
 
543 aa  866    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  93.67 
 
 
537 aa  1014    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  65.28 
 
 
534 aa  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  99.25 
 
 
535 aa  1063    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  71.4 
 
 
529 aa  743    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  80.41 
 
 
543 aa  872    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  68.93 
 
 
532 aa  727    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  68.1 
 
 
531 aa  746    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  79.5 
 
 
524 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  68.1 
 
 
530 aa  748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  68.1 
 
 
530 aa  749    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  67.99 
 
 
526 aa  733    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  68.1 
 
 
531 aa  752    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  99.81 
 
 
535 aa  1068    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  71.98 
 
 
530 aa  743    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  57.89 
 
 
533 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  99.44 
 
 
535 aa  1064    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  94.97 
 
 
537 aa  1022    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  68.1 
 
 
530 aa  749    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  82.78 
 
 
539 aa  865    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  67.73 
 
 
537 aa  726    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  57.76 
 
 
540 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  57.93 
 
 
541 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  56.8 
 
 
534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  56.3 
 
 
540 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  54.55 
 
 
555 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  55.58 
 
 
537 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  57.06 
 
 
535 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  57.74 
 
 
541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  55.51 
 
 
559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0474  cytochrome c oxidase, subunit I  55.07 
 
 
552 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0603  cytochrome c oxidase, subunit I  56.16 
 
 
565 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  57.93 
 
 
541 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0582  cytochrome c oxidase subunit I type  54.89 
 
 
552 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000068814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>