More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2670 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2670  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  98.87 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  91.35 
 
 		 266 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  79.46 
 
 		 259 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5899  hypothetical protein  80.46 
 
 		 261 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  75.94 
 
 		 264 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  60.39 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  59.85 
 
 		 267 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  58.37 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  57.25 
 
 		 274 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  56.65 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  53.94 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  52.53 
 
 		 261 aa  271  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  51.18 
 
 		 250 aa  261  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.43 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  51.02 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  50.41 
 
 		 249 aa  231  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1842  hypothetical protein  48.98 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00098228  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  45.42 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.54 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0086  hypothetical protein  38.37 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0071  hypothetical protein  38.37 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.91 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0112  hypothetical protein  38.37 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.26 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0884  hypothetical protein  39.34 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1454  cysteine-rich domain protein  39.18 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00283589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  40.5 
 
 		 239 aa  188  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.58 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  40.08 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  40.5 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  40.5 
 
 		 239 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  40.5 
 
 		 239 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  40.5 
 
 		 239 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  40.5 
 
 		 239 aa  185  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  40.5 
 
 		 239 aa  185  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  40.5 
 
 		 239 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  42.04 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  39.67 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  39.67 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.25 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  43.39 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  41.22 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  41.22 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  41.22 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  41.22 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  41.22 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  41.5 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  41.22 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  43.82 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.22 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  42.08 
 
 		 241 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.5 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.92 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  41.67 
 
 		 241 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.76 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  39.58 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  38.91 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  43.33 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  37.08 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  38.84 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  42.8 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  36.67 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.8 
 
 		 240 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  36.25 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  36.25 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.67 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  43.75 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  43.75 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  43.75 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  43.75 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  43.75 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  43.75 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  38.98 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.97 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  36.82 
 
 		 256 aa  168  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  43.33 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  42.5 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  43.3 
 
 		 236 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  45.45 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  42.5 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  39.92 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  37.92 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.67 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.67 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  41.67 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  38.11 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0375  hypothetical protein  35.77 
 
 		 289 aa  158  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000724873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  36.28 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.56 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1397  hypothetical protein  37.64 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  41.53 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  41.06 
 
 		 243 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.4 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.24 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.15 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  35.56 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  37.82 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0560  hypothetical protein  39 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.49 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>