203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2629 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  45.66 
 
 		 811 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  80.94 
 
 		 787 aa  1321    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  44.37 
 
 		 810 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  80.94 
 
 		 787 aa  1321    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  42.86 
 
 		 813 aa  646    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  94.15 
 
 		 786 aa  1512    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  95.17 
 
 		 786 aa  1521    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  75 
 
 		 788 aa  1241    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  79.67 
 
 		 787 aa  1306    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  42.61 
 
 		 813 aa  646    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  52.36 
 
 		 776 aa  843    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  95.04 
 
 		 786 aa  1535    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  55.01 
 
 		 808 aa  898    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  75.03 
 
 		 789 aa  1248    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 786 aa  1608    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  95.17 
 
 		 786 aa  1521    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  99.11 
 
 		 786 aa  1598    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  95.17 
 
 		 786 aa  1521    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  80.94 
 
 		 787 aa  1321    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  80.94 
 
 		 787 aa  1321    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  80.94 
 
 		 787 aa  1321    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  80.94 
 
 		 787 aa  1321    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  81.21 
 
 		 761 aa  1286    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  75.51 
 
 		 788 aa  1249    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  44.78 
 
 		 824 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  38.73 
 
 		 791 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  39.3 
 
 		 783 aa  515  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  38.48 
 
 		 820 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  35.71 
 
 		 799 aa  502  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  38.13 
 
 		 822 aa  502  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  38.57 
 
 		 814 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  36.65 
 
 		 860 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  36.18 
 
 		 774 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  35.72 
 
 		 856 aa  464  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  36.03 
 
 		 819 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  36.89 
 
 		 836 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  35.19 
 
 		 841 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  34.19 
 
 		 849 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  34.53 
 
 		 728 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  34.72 
 
 		 816 aa  429  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  33.47 
 
 		 929 aa  405  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  36.05 
 
 		 753 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  32.13 
 
 		 863 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  30.95 
 
 		 803 aa  372  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  30.47 
 
 		 751 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  30.75 
 
 		 757 aa  351  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  29.55 
 
 		 813 aa  320  7.999999999999999e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  30.59 
 
 		 826 aa  318  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  31.1 
 
 		 738 aa  317  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.49 
 
 		 905 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  28.49 
 
 		 926 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  30.33 
 
 		 1091 aa  312  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  27.69 
 
 		 935 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  29 
 
 		 794 aa  310  5.9999999999999995e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.99 
 
 		 922 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  27.51 
 
 		 934 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  27.95 
 
 		 938 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.09 
 
 		 924 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  30.2 
 
 		 727 aa  303  9e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  30.2 
 
 		 701 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  27.26 
 
 		 932 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 		 792 aa  298  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  28.01 
 
 		 792 aa  298  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  28.43 
 
 		 919 aa  293  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 		 765 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  27.06 
 
 		 937 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  29.5 
 
 		 778 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  27.53 
 
 		 839 aa  280  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  27.66 
 
 		 839 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  27.41 
 
 		 764 aa  278  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  27.93 
 
 		 765 aa  277  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  28.74 
 
 		 773 aa  276  9e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  27.75 
 
 		 765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  27.75 
 
 		 765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  27.22 
 
 		 790 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  28.68 
 
 		 774 aa  275  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  27.64 
 
 		 735 aa  273  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  26.98 
 
 		 765 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  27.09 
 
 		 765 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  28.36 
 
 		 774 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  27.72 
 
 		 765 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  26.7 
 
 		 765 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  26.7 
 
 		 765 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  28.95 
 
 		 799 aa  266  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  27.23 
 
 		 766 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  26.99 
 
 		 773 aa  263  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  27.65 
 
 		 766 aa  262  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00058  organic solvent tolerance protein precursor  27.14 
 
 		 784 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000114767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3545  Organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 		 784 aa  262  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000267581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3601  organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 		 784 aa  262  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.00000564634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0060  organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 		 784 aa  262  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00057  hypothetical protein  27.14 
 
 		 784 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0058  organic solvent tolerance protein  27.14 
 
 		 784 aa  262  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000825468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  28.26 
 
 		 781 aa  262  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 		 784 aa  260  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  27.18 
 
 		 801 aa  260  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 786 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  28.74 
 
 		 860 aa  259  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 786 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  26.71 
 
 		 786 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>