More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2616 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0220  apolipoprotein N-acyltransferase  77.97 
 
 
568 aa  833    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0883  apolipoprotein N-acyltransferase  78.15 
 
 
568 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
562 aa  1127    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  91.41 
 
 
562 aa  1020    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  92.38 
 
 
567 aa  1047    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0586  apolipoprotein N-acyltransferase  77.06 
 
 
571 aa  874    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3334  apolipoprotein N-acyltransferase  70.21 
 
 
582 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.16189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0625  apolipoprotein N-acyltransferase  72.26 
 
 
567 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2726  apolipoprotein N-acyltransferase  77.97 
 
 
568 aa  833    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  92.38 
 
 
567 aa  991    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0703  apolipoprotein N-acyltransferase  78.15 
 
 
568 aa  835    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2432  apolipoprotein N-acyltransferase  77.97 
 
 
568 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0407  apolipoprotein N-acyltransferase  67.5 
 
 
564 aa  753    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78277  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  98.58 
 
 
562 aa  1113    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  92.38 
 
 
567 aa  991    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0600  apolipoprotein N-acyltransferase  89.15 
 
 
553 aa  951    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2352  apolipoprotein N-acyltransferase  77.97 
 
 
568 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0718  apolipoprotein N-acyltransferase  78.15 
 
 
568 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  52.95 
 
 
503 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  52.95 
 
 
503 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  52.38 
 
 
523 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  53.49 
 
 
524 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  51.29 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  41.13 
 
 
532 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3832  apolipoprotein N-acyltransferase  43.71 
 
 
552 aa  332  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.826992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4762  apolipoprotein N-acyltransferase  44.17 
 
 
529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  43.5 
 
 
520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1862  apolipoprotein N-acyltransferase  38.49 
 
 
503 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480638  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1566  apolipoprotein N-acyltransferase  38.36 
 
 
500 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.910854  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  40.99 
 
 
500 aa  300  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  39.02 
 
 
487 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3384  putative apolipoprotein N-acyltransferase transmembrane  41.62 
 
 
526 aa  296  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0440  apolipoprotein N-acyltransferase  41.76 
 
 
516 aa  296  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117561  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0540  apolipoprotein N-acyltransferase  42.4 
 
 
532 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0524  apolipoprotein N-acyltransferase  42.4 
 
 
532 aa  289  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0553952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2158  apolipoprotein N-acyltransferase  41.65 
 
 
536 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  38.36 
 
 
507 aa  279  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  36.29 
 
 
497 aa  276  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0869  apolipoprotein N-acyltransferase  38.75 
 
 
509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1272  apolipoprotein N-acyltransferase  40.66 
 
 
550 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4208  apolipoprotein N-acyltransferase  40.81 
 
 
548 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3697  apolipoprotein N-acyltransferase  39.32 
 
 
574 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  35.52 
 
 
521 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4184  apolipoprotein N-acyltransferase  45.06 
 
 
534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.39031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  35.04 
 
 
512 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  33.77 
 
 
509 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  34.25 
 
 
512 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  34.25 
 
 
512 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  33.97 
 
 
515 aa  251  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  33.97 
 
 
515 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  33.97 
 
 
515 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  34.06 
 
 
512 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  33.9 
 
 
509 aa  249  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  36.91 
 
 
504 aa  249  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  34.06 
 
 
512 aa  249  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  34.25 
 
 
512 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  33.83 
 
 
529 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  34.06 
 
 
512 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  33.83 
 
 
529 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  33.83 
 
 
529 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  33.83 
 
 
529 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  33.83 
 
 
529 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  34.84 
 
 
509 aa  243  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  35.11 
 
 
507 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  37.31 
 
 
505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  33.14 
 
 
512 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  34.19 
 
 
511 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  34.65 
 
 
509 aa  237  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  36.14 
 
 
505 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  36.14 
 
 
505 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  34.06 
 
 
512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  34.06 
 
 
508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  35.66 
 
 
506 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  35.94 
 
 
505 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31.71 
 
 
510 aa  231  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  35.73 
 
 
507 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 
524 aa  230  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  32.61 
 
 
501 aa  229  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  30.61 
 
 
506 aa  225  2e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  35.73 
 
 
479 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  34.69 
 
 
506 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  33.2 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  33.21 
 
 
523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  35.39 
 
 
505 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  35.92 
 
 
500 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  34.39 
 
 
509 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  35.97 
 
 
489 aa  219  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  35.62 
 
 
510 aa  217  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  33.66 
 
 
506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  32.84 
 
 
492 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 
504 aa  213  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0477  apolipoprotein N-acyltransferase  32.2 
 
 
488 aa  210  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  31.66 
 
 
514 aa  210  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  30.61 
 
 
537 aa  210  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  33.77 
 
 
511 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  34.13 
 
 
511 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  32.5 
 
 
524 aa  203  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  30.79 
 
 
518 aa  203  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  32.29 
 
 
524 aa  200  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 
522 aa  200  6e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>