More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2605 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  99.17 
 
 
240 aa  480  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  88.03 
 
 
244 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  88.03 
 
 
244 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  90.79 
 
 
228 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  89.04 
 
 
228 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  87.98 
 
 
260 aa  417  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  81.2 
 
 
240 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  81.14 
 
 
228 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  81.14 
 
 
228 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  81.14 
 
 
228 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  81.14 
 
 
228 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  81.14 
 
 
228 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  81.14 
 
 
228 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  81.14 
 
 
228 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  74.46 
 
 
252 aa  362  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  75.88 
 
 
228 aa  362  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  72.81 
 
 
228 aa  345  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  52.49 
 
 
231 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  51.87 
 
 
224 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  46.95 
 
 
232 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  46.95 
 
 
232 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  46.95 
 
 
232 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  46.95 
 
 
232 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  45.75 
 
 
232 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  46.95 
 
 
232 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  46.95 
 
 
232 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11460  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.62 
 
 
233 aa  174  1e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0237278  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  46.95 
 
 
232 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  47.95 
 
 
230 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.4 
 
 
237 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  43.4 
 
 
240 aa  165  6e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  44.81 
 
 
237 aa  164  1e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2508  HAD family hydrolase  44.19 
 
 
237 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.076946  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0705  HAD family hydrolase  45.54 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531272  normal  0.478044 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  44.34 
 
 
237 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  44.34 
 
 
237 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  44.34 
 
 
237 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02024  hydrolase  43.88 
 
 
206 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5923  HAD family hydrolase  43.06 
 
 
228 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2141  hypothetical protein  46.48 
 
 
232 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00191152  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  40.18 
 
 
225 aa  148  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5664  HAD family hydrolase  42.47 
 
 
242 aa  140  1e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.665431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3728  HAD family hydrolase  42.01 
 
 
242 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4640  HAD family hydrolase  42.01 
 
 
242 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  40.67 
 
 
217 aa  139  4e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  36.7 
 
 
229 aa  139  5e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.68 
 
 
228 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
217 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.16 
 
 
229 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.98 
 
 
232 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  37.84 
 
 
227 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  37.21 
 
 
219 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0493  HAD family hydrolase  40.57 
 
 
230 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0405108  hitchhiker  0.00191213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  34.65 
 
 
231 aa  134  1e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  36.67 
 
 
223 aa  134  1e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  36.67 
 
 
223 aa  134  2e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  34.88 
 
 
228 aa  132  4e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.24 
 
 
223 aa  132  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.24 
 
 
229 aa  132  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  38.8 
 
 
222 aa  132  4e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 
228 aa  132  4e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.89 
 
 
228 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  36.45 
 
 
219 aa  131  7e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  34.2 
 
 
233 aa  131  8e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.5 
 
 
240 aa  130  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  34.42 
 
 
230 aa  131  1e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.73 
 
 
229 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
223 aa  129  4e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  39.34 
 
 
245 aa  129  5e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 
232 aa  127  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  36.11 
 
 
242 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
230 aa  125  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  35.91 
 
 
229 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  35.94 
 
 
229 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  35.27 
 
 
235 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  34.62 
 
 
204 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.39 
 
 
219 aa  121  1e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  36.02 
 
 
214 aa  120  1e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  32.86 
 
 
223 aa  120  2e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.17 
 
 
231 aa  120  2e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  32.56 
 
 
218 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  34.41 
 
 
230 aa  119  5e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
230 aa  118  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  38.81 
 
 
218 aa  118  1e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  36.22 
 
 
223 aa  117  2e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  34.58 
 
 
255 aa  114  1e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
228 aa  113  2e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  33.64 
 
 
223 aa  114  2e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
228 aa  112  4e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  33.79 
 
 
228 aa  112  4e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  33.18 
 
 
228 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.57 
 
 
214 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.43 
 
 
223 aa  110  1e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  35.23 
 
 
222 aa  111  1e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4727  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.55 
 
 
230 aa  110  1e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  33.17 
 
 
224 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  33.78 
 
 
230 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.14 
 
 
226 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  31.02 
 
 
212 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>