More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2557 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  79.35 
 
 
560 aa  740  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  76.61 
 
 
572 aa  749  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  76.61 
 
 
572 aa  749  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  69.63 
 
 
562 aa  749  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
564 aa  1114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  93.62 
 
 
588 aa  1022  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  76.17 
 
 
589 aa  761  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  69.31 
 
 
590 aa  703  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  76.61 
 
 
572 aa  749  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  99.65 
 
 
564 aa  1111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  93.09 
 
 
564 aa  1018  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  76.61 
 
 
589 aa  751  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  89.96 
 
 
593 aa  977  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  65.94 
 
 
569 aa  684  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  91.84 
 
 
588 aa  985  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  76.61 
 
 
572 aa  749  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  93.62 
 
 
588 aa  1022  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  76.61 
 
 
589 aa  751  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  48.04 
 
 
605 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  51.75 
 
 
561 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  46.9 
 
 
569 aa  422  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  50.51 
 
 
567 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  44.54 
 
 
573 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  42.44 
 
 
562 aa  360  5e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  41.04 
 
 
565 aa  357  4e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  36.63 
 
 
502 aa  284  4e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  37.45 
 
 
483 aa  280  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  40.87 
 
 
479 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  34.66 
 
 
473 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  36.89 
 
 
518 aa  230  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  33.4 
 
 
475 aa  229  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  35.8 
 
 
533 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  33.12 
 
 
484 aa  226  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
474 aa  214  3e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  47.84 
 
 
553 aa  214  4e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  34.07 
 
 
478 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  41.18 
 
 
548 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  44.24 
 
 
541 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  33.41 
 
 
478 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  33.61 
 
 
477 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  33.41 
 
 
478 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  32.85 
 
 
478 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  43.17 
 
 
521 aa  209  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  43.17 
 
 
521 aa  209  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  45.64 
 
 
521 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  33.26 
 
 
477 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.10651e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  33.19 
 
 
477 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  46.85 
 
 
549 aa  205  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  34.89 
 
 
480 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  43.28 
 
 
554 aa  202  1e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.54 
 
 
503 aa  200  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  32.44 
 
 
477 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  41.23 
 
 
514 aa  198  2e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  32.33 
 
 
477 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  33.7 
 
 
500 aa  197  5e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  32.16 
 
 
477 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  34.14 
 
 
490 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  27.87 
 
 
483 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  41.4 
 
 
486 aa  176  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  44.12 
 
 
525 aa  174  3e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  31.5 
 
 
484 aa  174  3e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  28.85 
 
 
484 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 
486 aa  171  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  29.91 
 
 
484 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 
486 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  31.43 
 
 
488 aa  166  1e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  30.32 
 
 
488 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  29.71 
 
 
478 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  35.14 
 
 
485 aa  164  4e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  30.31 
 
 
478 aa  164  5e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 
481 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  32.93 
 
 
411 aa  163  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  30.36 
 
 
487 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  33.01 
 
 
489 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  30.32 
 
 
483 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 
489 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 
489 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  32.69 
 
 
489 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  1.08832e-09 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  30.56 
 
 
490 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  27.81 
 
 
485 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 
489 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  28.75 
 
 
489 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  28.75 
 
 
489 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  30.44 
 
 
487 aa  156  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  28.75 
 
 
489 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  28.75 
 
 
489 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  29.22 
 
 
486 aa  156  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  29.34 
 
 
487 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.25556e-05  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  37.65 
 
 
566 aa  153  9e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  33.02 
 
 
489 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  37.1 
 
 
561 aa  149  1e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  28.75 
 
 
487 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  36.44 
 
 
553 aa  145  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
533 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.22653e-06  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  30.04 
 
 
494 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  32.49 
 
 
487 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  32.49 
 
 
487 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  32.49 
 
 
487 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  34.82 
 
 
554 aa  143  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  35.74 
 
 
533 aa  142  1e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>