More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2532 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
333 aa  660  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  98.8 
 
 
333 aa  654  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  93.96 
 
 
338 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  94.32 
 
 
338 aa  581  1e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  94.27 
 
 
341 aa  581  1e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  94.27 
 
 
341 aa  581  1e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  89.6 
 
 
330 aa  557  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  71.88 
 
 
350 aa  459  1e-128  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  67.9 
 
 
331 aa  416  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  68.14 
 
 
337 aa  417  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  64.52 
 
 
317 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  65.16 
 
 
317 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  2.98096e-05 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  61.54 
 
 
348 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  55.17 
 
 
342 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  58.73 
 
 
331 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  58.73 
 
 
331 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  52.38 
 
 
320 aa  357  1e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  60.32 
 
 
325 aa  349  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  53.46 
 
 
318 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  55.49 
 
 
325 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  49.37 
 
 
335 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  49.37 
 
 
335 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  49.37 
 
 
335 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  49.06 
 
 
335 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  48.1 
 
 
323 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  53.12 
 
 
333 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  48.89 
 
 
317 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.11496e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
333 aa  316  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  53.23 
 
 
342 aa  314  1e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  49.2 
 
 
322 aa  303  2e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  48.11 
 
 
321 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  45.51 
 
 
316 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  47.44 
 
 
321 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  47.3 
 
 
333 aa  295  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
323 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  49.52 
 
 
329 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  47.12 
 
 
333 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  47.32 
 
 
326 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  47.13 
 
 
321 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 
346 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  49.04 
 
 
317 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  46.18 
 
 
329 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  49.21 
 
 
322 aa  289  5e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89765e-07 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  47.13 
 
 
333 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  48.4 
 
 
326 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 
325 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  48.06 
 
 
324 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  5.80095e-05 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  47.76 
 
 
324 aa  285  6e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  47.74 
 
 
324 aa  285  6e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  47.74 
 
 
324 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  47.74 
 
 
320 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  47.74 
 
 
320 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  52.06 
 
 
340 aa  284  1e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  48.87 
 
 
326 aa  283  3e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  46.65 
 
 
331 aa  282  6e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  48.41 
 
 
347 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  47.37 
 
 
333 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  47.1 
 
 
320 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  47.59 
 
 
328 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  45.66 
 
 
326 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  45.66 
 
 
326 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  45.08 
 
 
330 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  45.54 
 
 
318 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  45.54 
 
 
318 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  45.66 
 
 
326 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  45.54 
 
 
318 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  45.54 
 
 
318 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  45.54 
 
 
318 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  48.4 
 
 
313 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  45.54 
 
 
318 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 
327 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  47.94 
 
 
332 aa  271  8e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 
321 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  48.88 
 
 
356 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  47.32 
 
 
320 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  46.79 
 
 
334 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  44.23 
 
 
318 aa  265  6e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  47.34 
 
 
327 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  41.48 
 
 
317 aa  262  5e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  48.73 
 
 
362 aa  262  5e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  41.96 
 
 
333 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 
317 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  45.48 
 
 
328 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  45.22 
 
 
313 aa  259  5e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  45.17 
 
 
342 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  44.34 
 
 
321 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  47.04 
 
 
332 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  42.33 
 
 
350 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  50.48 
 
 
316 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  44.27 
 
 
332 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 
316 aa  254  1e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  43.35 
 
 
321 aa  254  2e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  48.06 
 
 
320 aa  253  4e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 
334 aa  253  5e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  45.72 
 
 
331 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  50.81 
 
 
322 aa  252  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 
344 aa  252  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  42.64 
 
 
332 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.45 
 
 
330 aa  244  1e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 
330 aa  244  2e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  1.6632e-11 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>