174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2496 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  98.59 
 
 		 213 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  94.84 
 
 		 213 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  94.37 
 
 		 213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  94.84 
 
 		 213 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  94.37 
 
 		 213 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  89.2 
 
 		 213 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  83.17 
 
 		 209 aa  349  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  81.82 
 
 		 242 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  81.34 
 
 		 242 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  80.48 
 
 		 213 aa  345  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  80.48 
 
 		 213 aa  345  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  80.48 
 
 		 213 aa  345  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  80.48 
 
 		 213 aa  345  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  80.86 
 
 		 242 aa  345  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  81.82 
 
 		 212 aa  345  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  80.86 
 
 		 255 aa  344  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  81.34 
 
 		 212 aa  343  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  74.63 
 
 		 219 aa  307  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  74.4 
 
 		 209 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  71.98 
 
 		 209 aa  293  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  70.53 
 
 		 209 aa  288  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  68.78 
 
 		 213 aa  284  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  68.78 
 
 		 213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  61.65 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  58.45 
 
 		 223 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  59.51 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  57.56 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  57.49 
 
 		 217 aa  224  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  55.24 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  55.56 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  50 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  45.81 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  43.27 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  42.29 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  42.29 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  41.79 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  42.29 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  41.79 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  42.29 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  41.29 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  40.8 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  41.79 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  41.38 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  41.09 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  43.28 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  34.29 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  34.29 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  36.49 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  34.78 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  31.4 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  37.98 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  37.2 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  34.84 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  31.68 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.69 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  35.71 
 
 		 237 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  31.73 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  30.58 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  34.31 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  32.68 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  36 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  30 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  30 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  35.41 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  27.01 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  29.7 
 
 		 190 aa  95.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  32.35 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.51 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  31.43 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  28.44 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  28.22 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.8 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  26.73 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.63 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  26.73 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  27.67 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  27.18 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  29.41 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  29.9 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  28.07 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.82 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.35 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  27.75 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  33.49 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  29.47 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  28.23 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  30.43 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.28 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  30.53 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  25.12 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  29.73 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.54 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  28.29 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  31.6 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  26.54 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.6 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  26.11 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  28.91 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>