More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2377 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
296 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
296 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.79 
 
 
296 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.79 
 
 
296 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.44 
 
 
298 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.44 
 
 
296 aa  547  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0834  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.79 
 
 
297 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  85.14 
 
 
296 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.8 
 
 
296 aa  515  1e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.8 
 
 
296 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.8 
 
 
296 aa  514  1e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  86.16 
 
 
301 aa  517  1e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.8 
 
 
296 aa  515  1e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.8 
 
 
296 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.8 
 
 
296 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.8 
 
 
296 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.07 
 
 
301 aa  507  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3632  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  87.54 
 
 
301 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  67.58 
 
 
303 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  68.51 
 
 
300 aa  415  1e-115  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  68.17 
 
 
300 aa  414  1e-115  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  64.14 
 
 
276 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.18 
 
 
270 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.36 
 
 
264 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.17 
 
 
283 aa  320  2e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.36 
 
 
289 aa  314  1e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3166  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.9 
 
 
291 aa  313  3e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0961486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3229  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.9 
 
 
291 aa  313  3e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.33 
 
 
289 aa  311  8e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.92 
 
 
289 aa  311  8e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.56 
 
 
291 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.56 
 
 
291 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.56 
 
 
291 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.42 
 
 
287 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
290 aa  308  6e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
290 aa  308  6e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
290 aa  308  6e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.51 
 
 
291 aa  308  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.51 
 
 
291 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  54.51 
 
 
291 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.51 
 
 
291 aa  308  8e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.51 
 
 
291 aa  308  8e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.51 
 
 
291 aa  308  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.98602e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.51 
 
 
291 aa  308  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.51 
 
 
291 aa  308  8e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.51 
 
 
291 aa  308  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.01 
 
 
290 aa  306  2e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.24 
 
 
290 aa  304  9e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.29 
 
 
287 aa  303  2e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.08 
 
 
263 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.86 
 
 
261 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2874  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.56 
 
 
271 aa  295  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.18 
 
 
271 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.64 
 
 
270 aa  292  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.86 
 
 
275 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2087  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.94 
 
 
276 aa  283  2e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228254  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.1 
 
 
283 aa  283  2e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0543  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.47 
 
 
285 aa  283  3e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.43 
 
 
273 aa  281  6e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.98 
 
 
273 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2330  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.15 
 
 
292 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.98 
 
 
271 aa  279  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0625  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.42 
 
 
261 aa  278  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  5.03068e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0703  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.03 
 
 
294 aa  278  9e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.609213 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.87 
 
 
262 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1342  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.69 
 
 
294 aa  276  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.53 
 
 
270 aa  274  2e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.903456  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3224  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.45 
 
 
277 aa  273  4e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2010  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
294 aa  272  5e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.16 
 
 
266 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.16 
 
 
277 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.16 
 
 
266 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1075  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.56 
 
 
277 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.786743  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0991  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.56 
 
 
277 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3510  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.62 
 
 
265 aa  267  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.905017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.07 
 
 
280 aa  267  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.17 
 
 
261 aa  266  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.49 
 
 
265 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.86 
 
 
261 aa  265  5e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.96 
 
 
267 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2313  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.34 
 
 
294 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.86 
 
 
261 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.97 
 
 
290 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2763  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53 
 
 
287 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.323857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.81 
 
 
268 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.81 
 
 
268 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.18 
 
 
256 aa  261  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
266 aa  261  9e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.53 
 
 
256 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.17 
 
 
287 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.68 
 
 
267 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.8 
 
 
268 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.52 
 
 
262 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.8 
 
 
269 aa  257  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.48 
 
 
265 aa  255  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.8 
 
 
269 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.47 
 
 
270 aa  254  2e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.47 
 
 
270 aa  254  2e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.28 
 
 
268 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.93 
 
 
268 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>