85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2339 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 
178 aa  345  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  98.88 
 
 
178 aa  342  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5757  uncharacterized secreted protein-like  84.27 
 
 
178 aa  250  8e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  71.84 
 
 
174 aa  228  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  80.52 
 
 
165 aa  225  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  75.74 
 
 
185 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  75.74 
 
 
164 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  75.74 
 
 
164 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  75.74 
 
 
172 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  75.74 
 
 
172 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  75.74 
 
 
164 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0867  spore coat protein U domain-contain protein  66.29 
 
 
172 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464513  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  53.89 
 
 
173 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  50.69 
 
 
165 aa  124  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  46.39 
 
 
331 aa  112  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  46.39 
 
 
331 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  42.38 
 
 
325 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0006  Spore coat U domain protein  55.65 
 
 
170 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00295786  hitchhiker  0.0018193 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0005  spore coat protein  55.65 
 
 
170 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  42.25 
 
 
333 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  43.36 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  41.73 
 
 
318 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  39.87 
 
 
336 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  39.49 
 
 
336 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  39.49 
 
 
336 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  39.49 
 
 
336 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  39.49 
 
 
336 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  39.49 
 
 
345 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  47.37 
 
 
175 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  39.44 
 
 
372 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  39.49 
 
 
329 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  45.59 
 
 
167 aa  87.8  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  40.14 
 
 
320 aa  87.8  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  38.51 
 
 
339 aa  86.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  35 
 
 
344 aa  82.8  2e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  81.6  6e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  37.91 
 
 
156 aa  78.2  6e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  37.23 
 
 
153 aa  72.8  3e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1923  Spore coat U domain protein  37.75 
 
 
168 aa  71.2  8e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  36.36 
 
 
154 aa  70.9  8e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  36.36 
 
 
154 aa  70.9  8e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  34.03 
 
 
179 aa  70.1  2e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  39.01 
 
 
342 aa  66.6  2e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  37.12 
 
 
171 aa  63.5  2e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  38.05 
 
 
177 aa  60.8  9e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  35.43 
 
 
184 aa  60.1  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  35.43 
 
 
184 aa  60.1  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1829  putative signal peptide protein  28.25 
 
 
172 aa  59.3  3e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  36.51 
 
 
167 aa  58.5  4e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61550  hypothetical protein  34.59 
 
 
315 aa  55.5  4e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.302786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5302  hypothetical protein  34.9 
 
 
315 aa  55.5  5e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  41.48 
 
 
164 aa  53.9  1e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  40.88 
 
 
164 aa  53.9  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  40.41 
 
 
165 aa  53.5  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  32.12 
 
 
182 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1832  hypothetical protein  40.91 
 
 
325 aa  52.8  2e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.596397  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  34.65 
 
 
180 aa  52.4  3e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  30.85 
 
 
184 aa  52  5e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  36.63 
 
 
176 aa  51.2  8e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  36.63 
 
 
163 aa  50.4  1e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  36.63 
 
 
163 aa  50.4  1e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0344  hypothetical protein  36.36 
 
 
173 aa  49.7  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  30.61 
 
 
182 aa  48.5  6e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  35.16 
 
 
122 aa  48.1  6e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  30.77 
 
 
323 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  33.57 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1401  hypothetical protein  30.41 
 
 
321 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0475  hypothetical protein  30.41 
 
 
321 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1616  type 1 pili protein CsuE  30.41 
 
 
321 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1638  putative type 1 pili protein CsuE  30.41 
 
 
321 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0683  hypothetical protein  30.41 
 
 
321 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  29.29 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0877  hypothetical protein  30.41 
 
 
313 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1794  type 1 pili protein CsuE  30.41 
 
 
321 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  26.67 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1963  spore coat U domain-containing protein  31.37 
 
 
323 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0837976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3332  spore coat U domain-containing protein  30.52 
 
 
323 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4603  spore coat U domain-containing protein  29.3 
 
 
324 aa  45.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348761  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2676  spore coat protein U domain-contain protein  29.73 
 
 
321 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2363  spore coat U domain protein  29.87 
 
 
323 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27537  normal  0.662386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1445  Spore coat U domain protein  30.97 
 
 
337 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  27.87 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0143  spore coat U domain-containing protein  30.07 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001219  sigma-fimbriae tip adhesin  27.14 
 
 
323 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  29.7 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>