More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2269 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  89.82 
 
 		 393 aa  705    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  82.41 
 
 		 398 aa  681    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  89.82 
 
 		 393 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  89.82 
 
 		 393 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  96.95 
 
 		 393 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  89.82 
 
 		 393 aa  724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  82.91 
 
 		 398 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  89.57 
 
 		 393 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  81.91 
 
 		 398 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  96.69 
 
 		 393 aa  778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 393 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 393 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  89.57 
 
 		 393 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  89.82 
 
 		 393 aa  705    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  95.67 
 
 		 393 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  96.69 
 
 		 393 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  96.69 
 
 		 393 aa  778    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  89.82 
 
 		 393 aa  705    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  68.93 
 
 		 394 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  66.23 
 
 		 404 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  65.71 
 
 		 406 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  66.14 
 
 		 396 aa  534  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  66.4 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  64.69 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  55.87 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  51.23 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  55.41 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  55.47 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  47.31 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  50.74 
 
 		 406 aa  368  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  52.53 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  52.06 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  48.21 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 395 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  47.55 
 
 		 394 aa  350  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 395 aa  348  8e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  44.5 
 
 		 397 aa  345  8e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  42.46 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  45.27 
 
 		 394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 403 aa  323  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 393 aa  322  8e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  47.51 
 
 		 377 aa  322  9.000000000000001e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 395 aa  315  8e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 400 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  49.21 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  40.59 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  40.15 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 386 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  43.58 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  42.64 
 
 		 410 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  42.64 
 
 		 410 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  39.75 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  47.21 
 
 		 402 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  40.73 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  40.86 
 
 		 395 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 		 399 aa  299  5e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  41.01 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 398 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  40.25 
 
 		 399 aa  295  9e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  43.86 
 
 		 411 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 395 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  40.36 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.59 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 404 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 438 aa  285  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 391 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 409 aa  282  8.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  40.82 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  40.82 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  36.72 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>