More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2056 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 		 703 aa  1396    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  88.73 
 
 		 721 aa  1207    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  63.4 
 
 		 732 aa  868    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  63.35 
 
 		 782 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  89.9 
 
 		 704 aa  1237    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  62.8 
 
 		 748 aa  853    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  57 
 
 		 694 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  90.3 
 
 		 702 aa  1244    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  90.01 
 
 		 721 aa  1243    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  98.72 
 
 		 707 aa  1371    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  90.01 
 
 		 721 aa  1243    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  61.7 
 
 		 699 aa  851    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  63.49 
 
 		 698 aa  865    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  63.49 
 
 		 772 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  63.35 
 
 		 776 aa  867    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  63.35 
 
 		 776 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  63.49 
 
 		 698 aa  865    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  40.6 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  45.1 
 
 		 695 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  42.8 
 
 		 684 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  43.5 
 
 		 685 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  44.99 
 
 		 702 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  42.13 
 
 		 681 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.92 
 
 		 698 aa  491  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  43.12 
 
 		 711 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  37.63 
 
 		 697 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  42.9 
 
 		 741 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  40.84 
 
 		 697 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  40.35 
 
 		 673 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  40.43 
 
 		 711 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  39.89 
 
 		 697 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  37.32 
 
 		 696 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  36.43 
 
 		 697 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.37 
 
 		 689 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  41.33 
 
 		 663 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  35.34 
 
 		 695 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  40.17 
 
 		 722 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  41.33 
 
 		 663 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  41.33 
 
 		 663 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  36.57 
 
 		 697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  36.57 
 
 		 697 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  39.02 
 
 		 681 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  36.29 
 
 		 697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  36.35 
 
 		 701 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  36.57 
 
 		 697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.43 
 
 		 697 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  36.29 
 
 		 697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  39.83 
 
 		 676 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  39.17 
 
 		 676 aa  438  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  40.19 
 
 		 718 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  39.66 
 
 		 688 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  34.15 
 
 		 710 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.75 
 
 		 691 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.5 
 
 		 696 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.46 
 
 		 691 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.04 
 
 		 770 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.77 
 
 		 767 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.32 
 
 		 712 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  37.73 
 
 		 734 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  36.09 
 
 		 793 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  33.62 
 
 		 680 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  33.38 
 
 		 680 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  28.95 
 
 		 701 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  39.29 
 
 		 708 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  38.36 
 
 		 726 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  25.62 
 
 		 685 aa  206  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  41.88 
 
 		 723 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  27.17 
 
 		 713 aa  204  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  42.37 
 
 		 690 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  43.88 
 
 		 703 aa  203  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  38.39 
 
 		 703 aa  203  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  41.4 
 
 		 719 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  38.23 
 
 		 688 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  38.23 
 
 		 688 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  36.81 
 
 		 1283 aa  201  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  37.18 
 
 		 689 aa  200  9e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  25.62 
 
 		 685 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  41.2 
 
 		 724 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  39.12 
 
 		 688 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  39.12 
 
 		 689 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  43.4 
 
 		 692 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  41.84 
 
 		 714 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  42.75 
 
 		 704 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  34.13 
 
 		 703 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  38.78 
 
 		 710 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  36.51 
 
 		 719 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  39.43 
 
 		 685 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  35.29 
 
 		 677 aa  194  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  41.94 
 
 		 719 aa  194  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  40.21 
 
 		 670 aa  194  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  34.05 
 
 		 727 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  33.96 
 
 		 727 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  41.58 
 
 		 711 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  34.05 
 
 		 727 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  34.05 
 
 		 727 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  35.53 
 
 		 719 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  34.05 
 
 		 727 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  36.76 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  26.69 
 
 		 723 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.14 
 
 		 740 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>