More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1995 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  100 
 
 		 287 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  93.03 
 
 		 287 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  91.64 
 
 		 287 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  83.62 
 
 		 287 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  80.49 
 
 		 290 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  48.75 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  43.51 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.76 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  43.21 
 
 		 285 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  47.74 
 
 		 240 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.61 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  40.86 
 
 		 280 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  43.73 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  43.73 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.78 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  41.75 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  40.49 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  41.64 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  41.64 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  41.64 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  41.64 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  41.64 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  41.28 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  35.55 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  39.72 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  40.14 
 
 		 284 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  39.86 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  41.99 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  41.64 
 
 		 282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  39.07 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  39.21 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.28 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  44.6 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  43.93 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  43.26 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  35.44 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  36.05 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.92 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.58 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  24.56 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.55 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.56 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  33.33 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  32.78 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0840  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 526 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0894  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.99 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.57 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.5 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4063  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  35.52 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  37.4 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.25 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>