More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1870 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  77.06 
 
 
465 aa  726    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  70.99 
 
 
461 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  71.12 
 
 
474 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  100 
 
 
470 aa  957    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  98.09 
 
 
470 aa  942    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.27 
 
 
493 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  84.45 
 
 
476 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  76.51 
 
 
452 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  97.23 
 
 
470 aa  936    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  86.81 
 
 
470 aa  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  97.23 
 
 
470 aa  932    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.21 
 
 
472 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  84.26 
 
 
465 aa  826    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  84.66 
 
 
476 aa  828    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.53 
 
 
467 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  98.3 
 
 
470 aa  944    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  72.21 
 
 
472 aa  666    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  85.93 
 
 
465 aa  837    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  99.36 
 
 
470 aa  951    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  85.18 
 
 
469 aa  802    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  98.3 
 
 
470 aa  944    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  69.73 
 
 
454 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  78 
 
 
457 aa  722    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  76.84 
 
 
465 aa  725    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  78.79 
 
 
452 aa  731    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  84.49 
 
 
500 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  69.91 
 
 
454 aa  634  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  68.93 
 
 
460 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  61.48 
 
 
447 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  58.39 
 
 
446 aa  510  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  59.46 
 
 
446 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  60.84 
 
 
446 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1247  amidohydrolase  53.61 
 
 
464 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.092171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2080  amidohydrolase  53.39 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  hitchhiker  0.00336103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  52.16 
 
 
470 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  45.47 
 
 
455 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1728  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46 
 
 
452 aa  431  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.24 
 
 
459 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  45.15 
 
 
462 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.73 
 
 
450 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  51.95 
 
 
458 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  46.36 
 
 
503 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.77 
 
 
449 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.9 
 
 
461 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.54 
 
 
449 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.54 
 
 
453 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.77 
 
 
454 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4734  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  47.16 
 
 
455 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.06 
 
 
451 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.79 
 
 
451 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.67 
 
 
455 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.19 
 
 
451 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  46.8 
 
 
451 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  45.18 
 
 
458 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  43.12 
 
 
452 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.7 
 
 
459 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  43.78 
 
 
473 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.76 
 
 
455 aa  359  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3513  amidohydrolase  44.75 
 
 
449 aa  359  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.245268  normal  0.477319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2050  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.12 
 
 
448 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1626  amidohydrolase  44.65 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5674  amidohydrolase  45.17 
 
 
473 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.71 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  47.47 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.73 
 
 
454 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.29 
 
 
454 aa  353  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  42.29 
 
 
454 aa  352  8e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  44.39 
 
 
452 aa  351  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  45.64 
 
 
457 aa  348  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0197  amidohydrolase  46.62 
 
 
457 aa  346  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  46.57 
 
 
453 aa  339  5e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  46.53 
 
 
451 aa  323  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  42.48 
 
 
460 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  40.67 
 
 
461 aa  289  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  38.7 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  37.53 
 
 
462 aa  277  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  39.56 
 
 
460 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  38.46 
 
 
452 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  36.99 
 
 
453 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4464  amidohydrolase  36.26 
 
 
459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0716528 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6466  amidohydrolase  37.05 
 
 
459 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570923  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  39.23 
 
 
464 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3209  amidohydrolase  38 
 
 
476 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.790604  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2587  amidohydrolase  37.3 
 
 
476 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  35.37 
 
 
481 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  34 
 
 
434 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  34.47 
 
 
431 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.15 
 
 
441 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.96 
 
 
432 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  35.84 
 
 
432 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  36.11 
 
 
430 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.85 
 
 
445 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  33.26 
 
 
440 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  31.68 
 
 
422 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  31.29 
 
 
434 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  35 
 
 
442 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  34.48 
 
 
440 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  33.64 
 
 
435 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  35.62 
 
 
663 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  33.26 
 
 
435 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>