More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1825 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.98 
 
 		 545 aa  711    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.25 
 
 		 545 aa  711    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  60.48 
 
 		 544 aa  674    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1925  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  80.15 
 
 		 561 aa  918    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113828  normal  0.439232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  69.23 
 
 		 556 aa  765    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  68.76 
 
 		 542 aa  786    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2296  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.48 
 
 		 546 aa  964    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1439  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.48 
 
 		 544 aa  961    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64772  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  78.35 
 
 		 560 aa  902    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  57.2 
 
 		 543 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1367  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  92.87 
 
 		 547 aa  1053    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0878998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  71.11 
 
 		 541 aa  812    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  60.66 
 
 		 546 aa  682    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1799  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63 
 
 		 547 aa  710    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2456  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.16 
 
 		 548 aa  952    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.68 
 
 		 546 aa  709    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  95.98 
 
 		 547 aa  1087    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  94.7 
 
 		 547 aa  1075    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  61.97 
 
 		 551 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  95.66 
 
 		 569 aa  1098    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  62.8 
 
 		 545 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2141  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  83.45 
 
 		 589 aa  975    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61 
 
 		 541 aa  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  67.97 
 
 		 542 aa  793    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  58.21 
 
 		 546 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.52 
 
 		 542 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.74 
 
 		 542 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5305  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.07 
 
 		 549 aa  669    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2275  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  80.51 
 
 		 562 aa  924    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0961938  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0380  putative acyl-CoA synthetase  61.3 
 
 		 545 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  69.45 
 
 		 558 aa  792    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.48 
 
 		 544 aa  961    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.641249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2932  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.17 
 
 		 547 aa  687    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0465511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 584 aa  1201    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  71.03 
 
 		 534 aa  803    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.48 
 
 		 544 aa  961    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1203  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.48 
 
 		 544 aa  961    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2335  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  85.48 
 
 		 546 aa  965    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  95.48 
 
 		 569 aa  1095    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  58.3 
 
 		 546 aa  684    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  68.16 
 
 		 542 aa  795    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  98.9 
 
 		 547 aa  1110    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  57.43 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  54.96 
 
 		 549 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  57.78 
 
 		 550 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2639  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.81 
 
 		 480 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  55.09 
 
 		 553 aa  611  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4392  AMP-dependent synthetase and ligase  55.66 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  55.66 
 
 		 551 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2733  AMP-dependent synthetase and ligase  56.03 
 
 		 542 aa  598  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  54.17 
 
 		 549 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  54.81 
 
 		 549 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  53.23 
 
 		 542 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2845  AMP-dependent synthetase and ligase  53.3 
 
 		 540 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  53.42 
 
 		 542 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  53.62 
 
 		 542 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  52.4 
 
 		 547 aa  593  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  53.05 
 
 		 542 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  52.31 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  51.46 
 
 		 965 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0437  AMP-dependent synthetase and ligase  52.31 
 
 		 547 aa  579  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 542 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4187  AMP-dependent synthetase and ligase  53.63 
 
 		 545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554867  normal  0.517417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0495  AMP-dependent synthetase and ligase  51.66 
 
 		 553 aa  573  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1316  AMP-dependent synthetase and ligase  56.29 
 
 		 546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561388  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  52.62 
 
 		 534 aa  571  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  51.33 
 
 		 533 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0260985  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1426  AMP-dependent synthetase and ligase  54.8 
 
 		 544 aa  554  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0605  AMP-dependent synthetase and ligase  51.87 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.194166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1180  AMP-dependent synthetase and ligase  50.47 
 
 		 534 aa  535  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.941071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  48.14 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  49.07 
 
 		 544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  47.57 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  49.25 
 
 		 537 aa  508  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.92 
 
 		 537 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.92 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.74 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.74 
 
 		 537 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.74 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  45.11 
 
 		 537 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.74 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.74 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.92 
 
 		 537 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  47.64 
 
 		 539 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.74 
 
 		 537 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1771  AMP-dependent synthetase and ligase  49.44 
 
 		 539 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0767  AMP-dependent synthetase and ligase  48.87 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  46.74 
 
 		 542 aa  498  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4136  AMP-dependent synthetase and ligase  47.68 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5261  AMP-dependent synthetase and ligase  47.37 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  44.92 
 
 		 533 aa  478  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  46.18 
 
 		 544 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  46.86 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.86 
 
 		 543 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.83 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.83 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.83 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.95 
 
 		 546 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.76 
 
 		 546 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  45.59 
 
 		 549 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>